Новое мобильное приложение позволяет анализировать ДНК в любом месте

Исследователи из Института биоинформатики (BII) A*STAR разработали первое мобильное приложение для телефонов Android, анализирующее файлы секвенирования ДНК в формате ab1. Это позволяет как профессионалам, так и энтузиастам заниматься научным анализом в дороге, с удобством мобильного телефона.

Секвенирование ДНК — широко используемая методика, продвинувшая многие области биологических исследований. Однако анализ файлов секвенирования ранее проводился только на компьютерах. Это ограничение побудило доктора Сэмюэля К.Е. Гана, руководителя лаборатории APD, поставить задачу создать способ читать данные в движении. Результатом стала «DNAApp», разработанная за три месяца.

Приложение было бесплатно опубликовано в Google Play и Apple App Store. С момента запуска в начале апреля его скачали более 300 раз пользователи из более чем 11 стран.

DNAApp позволяет визуализировать и анализировать файлы секвенирования ДНК на iOS или Android. Пользователи могут:

• Оценивать качество последовательностей ДНК.
• Выполнять стандартные функции анализа: обратное дополнение, трансляцию.
• Искать специфические последовательности для идентификации биологически значимых регионов.

Это нативное приложение работает быстрее и эффективнее, повышая продуктивность в лаборатории. Оно функционирует без доступа к интернету и адаптировано под сенсорные экраны. Функции вроде поиска, свайпа или «перехода к» определённому участку последовательности дополняют существующие веб-инструменты биоинформатики.

«Мы рады, что "DNAApp" оказался полезным инструментом для занятого учёного. Мы надеемся оставаться на переднем крае технологий, создавая новые инструменты биоинформатики», — сказал доктор Ган.

Лаборатория планирует продолжать разработку мобильных приложений для анализа в молекулярной и микробиологии. Они повысят продуктивность и могут использоваться как образовательные инструменты.

«Благодаря инициативе доктора Гана, новое приложение DNAApp добавляет новое измерение в область анализа последовательностей ДНК. Впервые мобильное приложение продуктивно для определённых аспектов изучения данных секвенирования», — отметил доктор Франк Айзенхабер, исполнительный директор BII.