Исследователи Broad Institute используют новую полевую CRISPR-платформу для обнаружения генов растений

SHERLOCK — это новая CRISPR-платформа, которая является быстрой и портативной и позволяет обнаруживать и количественно определять гены растений для поддержки различных сельскохозяйственных применений. Дополнительные преимущества, включая возможность обработки неочищенных растительных экстрактов с минимальной подготовкой образцов нуклеиновых кислот, описаны в исследовательской статье, опубликованной в The CRISPR Journal.

Фэн Чжан из Broad Institute of MIT and Harvard (Кембридж, Массачусетс) и Массачусетского технологического института (Кембридж) и его соавторы Омар Абудейе, Джонатан Гутенберг и Макс Келлнер из Broad Institute, MIT и Гарвардской медицинской школы (Бостон, Массачусетс) представляют недавно разработанную систему обнаружения нуклеиновых кислот под названием SHERLOCK в статье "Nucleic Acid Detection of Plant Genes Using CRISPR-Cas13". Платформа преодолевает многие ограничения существующих систем обнаружения нуклеиновых кислот и обеспечивает чувствительность на уровне одной молекулы и специфичность на уровне одного нуклеотида с высокой способностью к мультиплексированию.

В статье описывается, как усовершенствованный CRISPR-инструмент SHERLOCK был впервые применён для растений. SHERLOCK может стать важным инструментом в сельском хозяйстве для быстрого обнаружения патогенов или вредителей и в селекции растений. SHERLOCK прост в использовании, портативен, готов к работе в полевых условиях и имеет низкую стоимость. Он может генерировать флуоресцентный или колориметрический сигнал, когда Cas13 распознаёт целевую последовательность нуклеиновой кислоты.

Родольф Баррангу, Ph.D., главный редактор The CRISPR Journal, заявляет: "Это отличный пример расширения CRISPR-технологий за пределы собственно редактирования генома, с использованием новых Cas-молекулярных машин для гибкого обнаружения интересующих последовательностей ДНК. Приложения выходят за рамки диагностики, и авторы показывают здесь, как это можно широко применять в сельском хозяйстве".