Впервые изучено бактериальное разнообразие Таблас-де-Даймьель
Исследователи из Университета Валенсии (UV) и Центра биомедицинских исследований (CIBER) в области эпидемиологии и общественного здравоохранения изучили структуру бактериального сообщества в четырех типах сред национального парка Таблас-де-Даймьель в Испании. Это были водная среда, первые сантиметры осадка (поверхностный осадок), более глубокий осадок (нижний осадок) и биопленки на границе воды и незатопленной почвы.
«Этот полузасушливый водно-болотный угодье является домом для большого разнообразия бактериальных групп с относительно низкими значениями доминирования, что указывает на хорошее разделение между различными таксономическими группами», — отмечает Джузеппе Д'Аурия, ведущий автор исследования.
Согласно исследованию, опубликованному в журнале Aquatic Microbial Ecology, четыре среды демонстрируют сходства и различия: «образец воды более похож на образец границы вода-осадок (верхний осадок), в то время как образец биопленки больше похож на образец более глубокого осадка».
Результаты также показывают большое количество все еще неизвестных последовательностей, обнаруженных во всех проанализированных образцах, что делает Таблас-де-Даймьель «резервуаром бактериального биоразнообразия и имеющим ключевое значение для его поддержания».
265 новых групп филумов
Исследователи извлекли общую ДНК из образцов. Используя методы молекулярной биологии, они получили последовательности ДНК бактериального гена 16S, который представляет собой своего рода сигнатуру или метку для каждой бактерии. «Биоинформатический анализ позволил нам составить профили бактериального распределения в каждой изученной среде».
Сравнивая найденные последовательности с базами данных международного бактериального разнообразия, команда обнаружила последовательности, еще неизвестные науке, открыв 265 новых групп филумов. «Большинство найденных групп филумов были связаны с большой группой Proteobacteria. Они были обнаружены в progressively меньших количествах в образцах из нижнего осадка, биопленок, воды и верхнего осадка».
Цианобактерии, осуществляющие фотосинтез аналогично микроводорослям и высшим растениям, были обнаружены в основном в образце поверхностного осадка на границе с водной толщей.
Национальный парк Таблас-де-Даймьель страдает от постоянных проблем с доступностью и качеством воды, связанных в первую очередь с сельскохозяйственной деятельностью в районе. Тем не менее, здесь обитает большое разнообразие растений, наземных и водных животных и микроорганизмов.
Он был объявлен Особой зоной защиты птиц (SPAB) в 1979 году и включен в список водно-болотных угодий международного значения в 1982 году. Исследовательская группа считает «жизненно важным» обеспечить, чтобы эта территория «не перестала быть водно-болотным угодьем, каким она была раньше, колыбелью биоразнообразия».