У земных видов больше общего, чем считалось ранее
Международная команда исследователей провела крупнейший в истории анализ белков (протеомов) у 100 различных видов — от бактерий и архей до растений и человека. Исследование показало, что, несмотря на фундаментальные различия, все формы жизни имеют ряд общих характеристик.
Ключевые общие черты
- Значительная часть протеомов всех изученных организмов сосредоточена на метаболизме и поддержании белкового баланса (гомеостаза).
- Большая доля белков у всех видов участвует в генерации энергии, хотя способы её получения различаются (от фотосинтеза до сжигания углеводов).
Методология и результаты
- Для анализа использовалась передовая технология масс-спектрометрии.
- Исследователям удалось удвоить количество экспериментально подтверждённых белков по сравнению с предыдущими предсказаниями, основанными только на генетическом коде и биоинформатических расчётах.
- Созданный набор данных содержит 8 миллионов точек данных с 53 миллионами взаимосвязей.
Доступность данных и перспективы
Все данные проекта находятся в открытом доступе на сайте Proteomes of Life. Этот крупный и однородный набор данных может быть использован другими учёными, в том числе с применением методов машинного обучения, для выявления новых корреляций.
Исследование — результат сотрудничества группы профессора Маттиаса Манна из Novo Nordisk Foundation Center for Protein Research и Института биохимии Макса Планка — опубликовано в ведущем научном журнале Nature.