Картографирование белков в пространстве и времени внутри клеток

Новый проект PROSPECTS, завершенный в 2013 году, предоставил новые данные о разнообразии, количестве и локализации белков в клетках, используя передовые технологии.

• Вызов протеомики: В отличие от стабильного генома, протеом (полный набор белков) постоянно меняется, отражая функцию и состояние клетки. Кроме того, один ген может производить сотни вариантов белка благодаря посттрансляционным модификациям.

• Достижения проекта: Ученые использовали масс-спектрометрию, электронную микроскопию и клеточную визуализацию для идентификации и количественной оценки белков. Было картировано около 14 000–15 000 различных типов человеческих белков.

• Цель и ценность: Картирование протеома создает базу данных для сравнения состояний клеток (например, здоровой и раковой) с целью выявления новых терапевтических мишеней.

• Мнения экспертов:

  • Руэди Аберсольд (ETH Zürich): Проект внес значительный вклад, но определение полного разнообразия протеома клетки остается сложной задачей.
  • Хельмут Майер (Ruhr-Universität Bochum): Сбор всех белковых данных может быть менее полезен для клиники из-за высокой биологической вариабельности. Важнее искать конкретные маркеры на основе патологических анализов.
  • Кэтрин Лиллей (University of Cambridge): Консорциум проделал огромную работу, продвинув поле на многих фронтах, особенно в методах пространственного картирования и разработке инструментов для изучения динамики белков. Такие данные прокладывают путь для клинических исследований.