Студенты UNSW расшифровали геном воллемии

Студенты Университета Нового Южного Уэльса (UNSW) впервые в мире секвенировали хлоропластный геном древней воллемии (Wollemi Pine). Это может раскрыть, как это «динозавровое» дерево пережило 200 миллионов лет дрейфа континентов и смены климата.

Используя машины для секвенирования нового поколения в Центре Рамачотти, студенты получили черновую последовательность длиной примерно 180 000 нуклеотидов — ДНК-код хлоропластного генома воллемии.

Воллемия (Wollemia nobilis) была известна науке по окаменелостям и считалась вымершей, пока в 1994 году Дэвид Нобл не обнаружил её в удалённом каньоне национального парка Воллеми, в 150 км к северо-западу от Сиднея.

В дикой природе известно менее сотни деревьев, растущих в трёх близко расположенных локациях. Эти деревья демонстрируют чрезвычайно низкий уровень генетического разнообразия и находятся под угрозой из-за интродуцированных грибковых заболеваний и изменения климата. Вид защищают от вымирания, сохраняя в тайне места диких популяций и широко культивируя его в Австралии и по всему миру.

Предварительные данные студентов показывают, что ДНК хлоропластов воллемии уникальна, но имеет общие черты с другими хвойными, такими как каури и араукария разнолистная (Norfolk Island Pine). Дальнейший анализ данных даст ключи к пониманию эволюции воллемии и других хвойных.

Студенты представили свои результаты в виде постера на конференции Ассоциации микрочипов и связанных технологий Австралазии в октябре 2009 года.

Этот исследовательский проект познакомил студентов с передовой технологией, позволившей получить объём данных, эквивалентный размеру генома человека, всего за несколько месяцев. Подобный опыт редко доступен в рамках программ бакалавриата и стал возможен благодаря выдающимся исследовательским мощностям UNSW и сотрудничеству между учёными UNSW и Королевского ботанического сада Сиднея.