VertLife: «Большие данные» для изучения биоразнообразия позвоночных

Проект VertLife Terrestrial, возглавляемый Йельским университетом, получил грант в $2.5 млн от Национального научного фонда США (NSF). Цель — создать аннотированные родословные деревья, вычислительные инструменты и цифровую базу данных для всех 33 000 современных видов наземных позвоночных: млекопитающих, птиц, амфибий и рептилий.

Ключевые задачи проекта:

• Построение тысяч филогенетических деревьев, охватывающих все виды, с указанием неопределенностей в их точном положении.
• Сбор новых генетических данных с помощью методов параллельного секвенирования для примерно 4 000 видов, у которых такая информация отсутствует.
• Предоставление полных жизненных историй, описаний ключевых эволюционных и экологических признаков для каждого вида.
• Разработка встроенных инструментов для анализа и визуализации, позволяющих проводить сравнения признаков, географическое сравнение и мониторинг для охраны природы.

Интеграция и доступность:

• Весь массив данных VertLife будет интегрирован с онлайн-платформой Map of Life.
• Информация станет общедоступной, позволяя пользователям изучать родственные связи, признаки и природоохранный статус видов через интерактивные деревья и карты.
• Проект станет флагманом программы NSF Genealogy of Life, нацеленной на создание открытой универсальной базы данных и инструментов анализа для ученых.

Руководство и участники:

Ведущий исследователь — Уолтер Йетц, доцент экологии и эволюционной биологии Йеля. В проекте также участвуют Университет штата Луизиана, Калифорнийский университет в Беркли, Университет Джорджа Вашингтона и Университет Флориды.

Для науки и образования:

Проект расширяет предыдущие исследования Йетца по созданию полного родословного древа птиц и расчету эволюционно уникальных видов. VertLife также включает онлайн-уроки и музейные экспозиции, делая «большие данные» по биоразнообразию доступными для студентов и ученых.