Исследование распространения устойчивой к антибиотикам E. coli

Новое исследование показывает, что устойчивость E. coli к антибиотикам неуклонно растет с начала 2000-х годов, несмотря на попытки контроля. В крупнейшем на сегодняшний день геномном исследовании E. coli, которое длилось более 16 лет в Норвегии, ученые отследили распространение генов устойчивости и показали, что эти гены передаются между штаммами бактерий.

Исследователи из Института Сэнгера и Университета Осло отследили множественную лекарственную устойчивость (МЛУ) в Норвегии и сравнили данные с предыдущим исследованием из Великобритании. Они обнаружили, что устойчивые штаммы появились примерно в одно время, но в британской популяции их распространение росло быстрее.

Результаты, опубликованные в The Lancet Microbe, показывают, что отслеживание таких штаммов критически важно для контроля за устойчивой E. coli, которая представляет серьезную проблему в больницах, вызывая тяжелые инфекции и смертность. Понимание того, как гены устойчивости передаются между штаммами и что вызывает ее развитие, может помочь сдержать рост резистентности.

Escherichia coli — частая причина инфекций кровотока во всем мире, и их число растет последнее десятилетие. В норме E. coli безвредно обитает в кишечнике, но при попадании в кровь на фоне ослабленного иммунитета может вызывать тяжелые, угрожающие жизни инфекции. Усугубляет проблему для медиков то, что МЛУ становится частой чертой таких инфекций, а варианты лечения во многих случаях ограничены.

В крупнейшем исследовании такого рода и лишь втором систематическом лонгитюдном геномном исследовании бактериемической E. coli ученые обработали общенациональный каталог из более чем 3200 образцов пациентов за 16 лет. Используя масштабное секвенирование ДНК, они проследили возникновение устойчивости и сравнили данные с аналогичным исследованием в Великобритании.

Команда обнаружила, что МЛУ начала расти и появляться в большем числе штаммов в начале 2000-х из-за давления антибиотиков, и теперь в Норвегии присутствуют несколько штаммов МЛУ E. coli. Однако МЛУ E. coli, по-видимому, более широко распространена в Великобритании, несмотря на схожую политику использования антибиотиков. Разницу может частично объяснить значительно большая численность населения Великобритании. Для более точного сравнения и выявления причин быстрого распространения в одних регионах по сравнению с другими необходимы дальнейшие исследования.

МЛУ у бактерий встречается относительно редко. Однако новое исследование показало, что линии, которые ранее не считались устойчивыми, приобрели гены резистентности. Это демонстрирует возросшую способность E. coli обмениваться генами МЛУ посредством горизонтального переноса.

Профессор Юкка Корандер, соавтор исследования: "Большое количество образцов из норвежской популяции и высокий уровень геномной детализации позволили нам сделать гораздо более далеко идущие выводы, чем когда-либо прежде. Это исследование демонстрирует силу системного национального надзора за устойчивыми организмами, который не только собирает данные, но и делает их доступными для углубленного анализа".

Исследователи надеются провести аналогичную работу в Великобритании, чтобы получить полный 16-летний набор данных и точнее отслеживать МЛУ E. coli.

Доктор Ребекка Гладстоун, ведущий автор: "Возможность оценить временные рамки экспансии клонов МЛУ E. coli и выявить множественные случаи нового приобретения генов устойчивости особенно важна, поскольку это стало возможным впервые".

Профессор Джулиан Паркхилл, соавтор: "Долгосрочные исследования, подобные этому, дают глубокое понимание сложной эпидемиологии инфекций кровотока. Следующий шаг — дальнейшее изучение факторов, определяющих успех новых патогенных клонов, чтобы найти способ контролировать и минимизировать распространение множественной лекарственной устойчивости".