Новый метод сканирования ДНК может ускорить диагностику рака и редких заболеваний
В статье, опубликованной в Nature Biotechnology, ученые показали, что теперь можно селективно и более быстро секвенировать фрагменты ДНК, игнорируя нерелевантные участки. Это позволяет получать ответы быстрее и экономичнее, чем раньше.
Профессор Мэтт Лус, руководивший проектом, пояснил: "Мы можем секвенировать те части ДНК, которые хотим, и игнорировать те, которые не хотим. Это позволяет нам исследовать и секвенировать регионы даже таких больших геномов, как человеческий".
Ключевые достижения метода ReadFish:
- Метод ReadFish позволяет секвенсору MinION (портативному устройству от Oxford Nanopore) в реальном времени выбирать для анализа только целевые участки генома.
- Ученые продемонстрировали возможность быстрого "сканирования" человеческого генома для обнаружения генетических аномалий.
- В качестве примера изменение в ДНК, ответственное за определенный тип рака, было локализовано менее чем за 15 часов. Для сравнения, типичный полный анализ генома занимает несколько дней.
Потенциальное влияние:
- Метод открывает возможности для быстрого поиска генетических изменений, ведущих к заболеваниям, таким как рак, что может иметь большое значение для диагностики.
- Технология позволяет получать быстрые ответы на недорогих и простых в использовании устройствах.
Это исследование развивает работу команды 2016 года, где впервые была продемонстрирована техника высокоселективного секвенирования в реальном времени на платформе Oxford Nanopore.