Может ли трёхмерная организация генома Т-клеток регулировать (ауто)иммунитет?

Исследовательская группа доцента Хараламбоса Г. Спилианакиса, аффилированного профессора Института молекулярной биологии и биотехнологии FORTH, работала над определением того, может ли трёхмерная организация генома Т-клеток регулировать (ауто)иммунитет.

В этом усилии ключевой была роль лабораторий Христофора Николау (Университет Крита, IMBB-FORTH, BSRC Al. Fleming), Сёрена Франценбурга (Университетская клиника Шлезвиг-Гольштейн, Киль, Германия) и Дариуша Плевчински (Варшавский университет, Польша).

Исследователи в Ираклионе (Крит) создали мышь с T-клеточно-специфичным нокаутом, несущей делецию гена Satb1. ДНК в клетках взаимодействует с множеством белков, которые упаковывают и регулируют её, чтобы она поместилась в ядре.

Белок SATB1 связывается с хроматином и регулирует трёхмерную организацию генома Т-лимфоцитов. Эта модель мыши демонстрирует распространённый аутоиммунитет, проявляющийся проблемами с шерстью и кожей, воспалением в различных тканях и лимфоидных органах (тимус и селезёнка).

Используя множество геномных подходов, учёные показали, что белок SATB1 по сути создаёт сети генов в трёхмерном пространстве Т-лимфоцита, и их экспрессия регулируется с огромной точностью.

Отсутствие этого белка-организатора хроматина Т-лимфоцитов приводит к дерегуляции экспрессии иммуноспецифичных генов и, как следствие, к развитию обширного воспаления и аутоиммунитета.

Следующий шаг команды в области исследования аутоиммунитета включает разработку высокоспецифичных малых молекул для проверки их способности ингибировать воспаление и аутоиммунитет — сначала на модели мыши, а затем и у людей.

Данные опубликованы в журнале Nature Communications.