Сплайсосомы: новый метод отслеживает белки, участвующие в сплайсинге РНК
Сплайсосомы — это молекулярные машины, которые вырезают лишние участки из РНК-копий генов и собирают точные инструкции для построения белков. Сбои в этом процессе могут приводить к таким заболеваниям, как рак или спинальная мышечная атрофия.
Профессор Cold Spring Harbor Laboratory (CSHL) Адриан Крайнер, участвовавший в разработке первого одобренного FDA лечения этого заболевания, и его команда обнаружили, что два важных регуляторных белка работают вместе, чтобы поддерживать правильный ход сплайсинга.
Один из этих регуляторов, белок SRSF1, исследуется в лаборатории Крайнера с 1990 года. Было установлено, что клеткам необходим SRSF1 для сплайсинга, а его избыток может стимулировать раковый рост.
В новом исследовании, опубликованном в Proceedings of the National Academy of Sciences, Крайнер и аспирант Данило Сеговия использовали новую технику для отслеживания всех белков, которые сближаются с SRSF1 внутри клетки, даже на очень короткое время.
«Вы получаете историю всех белков, которые находились в непосредственной близости от SRSF1», — говорит Сеговия.
Список взаимодействий оказался обширным. Особый интерес вызвало взаимодействие SRSF1 с белком DDX23 — ферментом, который помогает новособранным сплайсосомам принять правильную форму для сплайсинга РНК.
В сотрудничестве с директором по исследованиям CSHL Лимором Джошуа-Тор команда подтвердила сильное взаимодействие между SRSF1 и DDX23. По мнению исследователей, это соединение может быть важно для правильного позиционирования или активации DDX23 в нужный момент.
«SRSF1, по-видимому, играет здесь довольно центральную роль, — говорит Крайнер. — Он необходим для более раннего этапа сборки сплайсосомы и, кажется, находится в ключевой точке перехода между стадиями её созревания».
Составленный список белков, взаимодействующих с SRSF1, предоставляет исследователям новые подсказки для понимания работы этого критического регулятора, что может помочь в поиске новых подходов к лечению рака и других заболеваний.