Генетический прорыв поможет сохранить сосну белокорую
Исследователи под руководством Университета Колорадо в Денвере впервые разработали надежные генетические маркеры — ядерные микросателлиты — для сосны белокорой (Pinus albicaulis). Это открытие может улучшить перспективы выживания этого вида, численность которого стремительно сокращается по всему ареалу. В настоящее время рассматривается вопрос о внесении этого дерева в список видов, находящихся под угрозой исчезновения.
Согласно статье, опубликованной в PLOS ONE, новые генетические маркеры представляют собой полезный и недорогой метод для скрининга генетического разнообразия сосны белокорой. Этот инструмент имеет множество применений для защиты быстро исчезающего дерева. Предыдущие попытки найти такие маркеры для этого вида терпели неудачу из-за сложности и размера его генома, который почти в девять раз больше человеческого.
«Благодаря этому прорыву ученые могут начать скрининг сосен белокорых на признаки устойчивости к болезням, для стратегического сбора семян и других усилий по сохранению и смягчению последствий изменения климата», — заявила доктор Диана Томбек, профессор кафедры интегративной биологии CU Denver.
Угрожаемый хвойный вид, произрастающий на больших высотах в западных штатах США и Канаде, важен для защиты водосборных бассейнов и является источником пищи для диких животных, включая гризли. Угрозы для сосны белокорой включают инвазивное заболевание (гриб Cronartium ribicola), горного соснового лубоеда, сильные пожары и изменение климата.
Выпускница CU Denver Мариан Ли и Томбек возглавили исследовательскую группу, которой удалось разработать 23 микросателлитных маркера для сосны белокорой, включая 10 новых и 13, перенесенных от других видов сосен.
Члены исследовательской группы применили методы секвенирования генома к сосне белокорой и выявили более 1000 кандидатных геномных регионов для анализа. Лабораторные методы позволили преобразовать эти регионы в простые генетические тесты. Детальный скрининг маркеров и популяционный анализ двух популяций из Йеллоустоуна подтвердили успешность разработанных маркеров.