Крупномасштабное секвенирование геномов золотых рыбок и карпа раскрывает их происхождение

Международная группа исследователей из Китая секвенировала геномы большого количества золотых рыбок и карпов, что раскрыло их общее происхождение. Результаты опубликованы в Proceedings of the National Academy of Sciences.

Золотые рыбки были одомашнены человеком более 1000 лет назад, но, в отличие от большинства других домашних видов, их разводили не для еды или общения, а в декоративных целях. Широкий спектр человеческих вкусов привел к селекции на разнообразные признаки: окраску, форму плавников и хвоста. Это вызвало множество изменений в геноме, которые до сих пор были плохо изучены.

В работе было секвенировано 185 репрезентативных образцов золотых рыбок и 16 образцов дикого карася. Известно, что золотые рыбки имеют 25 хромосом, но каждая особь несет 100 хромосом — по два набора с двумя копиями каждой. Большинство генетических вариантов в геноме золотой рыбки являются довольно недавними, а некоторые настолько новы, что представляют собой единственный вариант в данной линии (так называемые «генетические подметания», sweeps).

Изучив эти подметания, исследователи обнаружили, что в верхнем 1% всех изученных sweeps содержится чуть менее 1000 генов. Большинство различий были связаны с пигментацией и формой тела, некоторые — с поведением. Также было проведено секвенирование геномов бесспинных «яйцевидных» золотых рыбок, что позволило идентифицировать около 400 генов, связанных с развитием спинного плавника.

Команда утверждает, что собрала один из наиболее полных геномов золотой рыбки на сегодняшний день и раскрыла генетическую архитектуру многих анатомических особенностей этой популярной рыбы.