Ученые секвенировали геном ржавчины миртовых

Ученые из Австралии и Новой Зеландии составили полную генетическую карту грибка Austropuccinia psidii, вызывающего инвазивное заболевание — ржавчину миртовых. Эта болезнь с момента появления в Австралии десять лет назад поставила на грань исчезновения как минимум три вида местных растений.

Ключевые результаты:

• Собранный геном является крупнейшим из известных грибных геномов и содержит около миллиарда пар оснований ДНК.
• Огромный размер генома объясняется обилием транспозонных элементов — генетически нестабильных регионов, которые, возможно, помогли грибку адаптироваться к новым растениям-хозяевам.
• Для сравнения: другие ржавчинные грибы имеют около 80 млн пар оснований, а геном вируса COVID-19 — около 30 000.

Значение исследования:

Ржавчина миртовых угрожает растениям семейства Миртовые (Myrtaceae) в Австралии и Новой Зеландии, включая эвкалипты, мелалеуку (бумажнокорое дерево), чайное дерево, каллистемон и многие другие виды. Во всем мире потенциально уязвимы 5500 видов растений.

Расшифровка генома — это критически важный шаг для понимания механизмов заражения. Теперь ученые используют его как инструмент, чтобы:

• Изучить, как A. psidii заражает растения.
• Выявить гены патогена и растения-хозяина, взаимодействующие на ранних стадиях инфекции.
• Найти способы повысить устойчивость растений для лучшего контроля над болезнью.

Исследование, инициированное профессором Робертом Парком под руководством доктора Пери Тобиас из Сиднейского университета, опубликовано в журнале G3: Genes, Genomes, Genetics. Сборка генома заняла три месяца с использованием высокопроизводительных вычислений и стала результатом масштабного международного сотрудничества.