Как растительно-паразитическая нематода заражает широкий круг организмов

Нематологи из Калифорнийского университета в Дэвисе получили представление о том, как ДНК северной галловой нематоды (Meloidogyne hapla) способствует её успеху в заражении широкого круга растений — от однодольных и двудольных до однолетних культур и древесных растений.

Международная исследовательская группа под руководством учёных из UC Davis представила наиболее полную и непрерывную сборку генома для растительно-паразитической нематоды на сегодняшний день.

Ключевые открытия:

• Неканонические теломеры: Meloidogyne hapla использует необычные повторы ДНК на концах своих хромосом вместо типичных теломер, что предполагает альтернативный способ защиты концов хромосом.
• Гибкая структура генома: Структура хромосом различается между изолятами этого нематода, наблюдаются разрывы, воссоединение и рекомбинация между хромосомами разных изолятов.
• Горячие точки рекомбинации: Исследование выявило связь между архитектурой генома, ландшафтами рекомбинации и взаимодействиями паразит–хозяин.

Значение исследования:

• Гибкость генома может объяснять, как галловые нематоды способны изменять спектр поражаемых растений-хозяев.
• Полученные данные станут ресурсом для изучения геномов других важных видов нематод и идентификации генов, способствующих успешному паразитизму.
• Эта информация должна способствовать разработке оптимальных стратегий контроля и созданию растений с повышенной устойчивостью.

Контекст проблемы:

Растительно-паразитические нематоды, особенно галловые (RKN), наносят миллиарды долларов ущерба сельскохозяйственным культурам по всему миру, заражая разнообразные растения и вызывая образование корневых галлов, отставание в росте, снижение урожайности и деформацию продукции.

Исследование опубликовано в журнале PLOS Pathogens под названием "High-resolution genome assembly and linkage mapping in Meloidogyne hapla reveal non-canonical telomere repeats and recombination hotspots associated with effector proteins".