Анализ митохондриального генома тропических галловых нематод

Полифагные партеногенетические галловые нематоды рода Meloidogyne считаются наиболее значимыми вредителями-нематодами в субтропическом и тропическом сельском хозяйстве. Несмотря на критическую важность правильной диагностики, идентификация этих патогенов остаётся проблематичной. Учёные из Гентского университета (Бельгия), Национальной организации по защите растений (Нидерланды) и Международного института тропического сельского хозяйства (Нигерия) усовершенствовали идентификацию нематод.

Традиционно используемые диагностические стратегии, включая морфометрию, тесты на круг растений-хозяев, биохимические и молекулярные методы, теперь оказались ненадёжными из-за недавно предложенного гибридного происхождения галловых нематод. Чтобы определить подходящий регион для штрихкодирования этих патогенов, были проанализированы девять быстро эволюционирующих митохондриальных кодирующих генов.

Ключевые выводы исследования:

• Построенные сети гаплотипов выявили тесно связанные линии, что указывает на:
  • Недавнее видообразование.
  • Распространение с помощью человека через сельскохозяйственную деятельность.
  • Свидетельства сетчатой эволюции (reticulate evolution) внутри вида M. arenaria.
• Нуклеотидные полиморфизмы содержат достаточно вариаций, чтобы различать эти близкородственные линии.
• Полнота сортировки линий была проверена на 80 популяциях из различных географических регионов и с разных растений-хозяев.
• Митохондриальные гаплотипы тесно связаны и соответствуют традиционным паттернам изоферментов эстеразы. Это означает, что разные партеногенетические линии можно надёжно идентифицировать с помощью митохондриальных гаплотипов.

Практический результат: Исследование показывает, что регион Nad5 может надёжно идентифицировать основные линии тропических галловых нематод.