Улучшенная система прайм-редактирования делает геномные правки размером с ген в клетках человека на терапевтическом уровне

Ученые из Broad Institute MIT и Гарварда усовершенствовали технологию редактирования генов, которая теперь способна эффективно вставлять или заменять целые гены в геноме человеческих клеток. Этот прогресс может быть потенциально полезен для терапевтических применений.

Разработка из лаборатории Дэвида Лю может помочь в создании единой генной терапии для таких заболеваний, как муковисцидоз, вызванных сотнями или тысячами различных мутаций в одном гене. Вместо создания отдельной терапии для каждой мутации новый подход позволяет вставить здоровую копию гена в его нативное место в геноме.

Новый метод, названный eePASSIGE, сочетает:

  • Прайм-редактирование — для внесения точных изменений до ~100-200 пар оснований.
  • Новоразработанные рекомбиназные ферменты — для эффективной вставки крупных фрагментов ДНК длиной в тысячи пар оснований в специфические сайты генома.

Система осуществляет правки размером с ген в несколько раз эффективнее аналогичных методов. Результаты опубликованы в Nature Biomedical Engineering.

Ключевые улучшения и эффективность:

  • Исследователи выявили, что фермент Bxb1 ограничивал эффективность предыдущей версии системы (PASSIGE).
  • С помощью инструмента PACE (phage-assisted continuous evolution) был создан улучшенный вариант фермента — eeBxb1.
  • eePASSIGE с eeBxb1 интегрирует в среднем 30% генетического «груза» в клетки мыши и человека. Это:
    • В 4 раза эффективнее исходного PASSIGE.
    • В 16 раз эффективнее другого современного метода (PASTE).

Значение и перспективы:

  • Дэвид Лю: «Насколько нам известно, это один из первых примеров программируемой целевой интеграции генов в клетках млекопитающих, удовлетворяющий основным критериям потенциальной терапевтической значимости... При такой эффективности многие, если не большинство, заболеваний с потерей функции гена могут быть улучшены».
  • Смрити Панди: Система открывает возможности для клеточной терапии, когда гены точно вставляются в клетки ex vivo перед введением пациенту.
  • Дэниел Гао: Высокая эффективность и универсальность eePASSIGE может обеспечить новую категорию геномных лекарств и стать инструментом для фундаментальных исследований.

Следующие шаги: Команда работает над объединением eePASSIGE с системами доставки, такими как инженерные вирусоподобные частицы (eVLPs), для преодоления ограничений терапевтической доставки редакторов генов in vivo.

2024-06-10