Влияние малых полианионов на ретровирусы
Ретровирус — это вирус, который встраивает копию своего генома в ДНК клетки-хозяина, изменяя её геном. В цитоплазме клетки вирус использует фермент обратную транскриптазу для синтеза ДНК на основе своей РНК. Затем вирусная ДНК (провирус) встраивается в геном хозяина ферментом интегразой, и клетка начинает производить белки для сборки новых вирусных частиц.
Незрелые частицы ретровирусов собираются в цитозоле или на плазматической мембране. Бетаретровирусы, такие как вирус Мейсона-Пфайзера обезьян (M-PMV), относятся к морфологическому типу D и собирают внутрицитоплазматические частицы типа A (ICAPs) в перицентриолярной области.
«Считалось, что сборку незрелых ретровирусных частиц стимулируют в основном белок-белковые и белок-нуклеиновокислотные взаимодействия CA–CA и NC–вирусная геномная РНК соответственно. Однако всё больше данных показывает, что взаимодействия белков с малыми молекулами также играют ключевую роль в стимуляции формирования гексамерной решётки. Сочетание биохимических и структурных данных показало, что одна из таких малых молекул, инозитолгексафосфат (IP6), влияет на сборку незрелых частиц ВИЧ-1», — говорит доктор Михаэла Румлова из Пражского химико-технологического университета.
Данные показали, что, несмотря на структурное сходство в сегменте, соединяющем области CA–NC, лишь некоторые ретровирусы эволюционировали стратегию использования малых полианионных молекул в качестве стабилизаторов гексамерной незрелой решётки.
- Сборка незрелых частиц ВИЧ-1 и, вероятно, других лентивирусов стабилизируется IP6 концентрационно-зависимым образом с пиком при соотношении белковый гексамер:IP6 = 1:1.
- Сборка представителей альфаретровирусов (RSV) и гаммаретровирусов (MLV) также усиливается полианионами, но механизм взаимодействия остаётся неясным.
«Наши результаты показывают, что сборка незрелых частиц RSV и MLV действительно стимулировалась присутствием мио-инозитолгексафосфата и мио-инозитола соответственно. В отличие от них, на сборку M-PMV как представителя бетаретровирусов влияния не наблюдалось», — заключают исследователи.