Обнаружен потенциально новый вирус в просе прутьевидном

Исследователи из Университета Иллинойса впервые подтвердили наличие потенциально нового вируса, принадлежащего к роду Marafivirus, в просе прутьевидном (switchgrass) — культуре, рассматриваемой для коммерческого производства целлюлозного этанола.

Вирус ассоциирован с мозаичными и желтыми штриховатыми симптомами на листьях растения. Он может снижать фотосинтез и уменьшать урожай биомассы. Представители этого рода, например, типовой вид Maize rayado fino virus (MRFV), вызывают значительные потери урожая кукурузы в Мексике, Центральной и Южной Америке.

"Вирусные заболевания представляют потенциальную серьезную угрозу для биоэнергетических культур, таких как мискантус, энергетический тростник и просо прутьевидное", — заявил Брайт Агиндотан, научный сотрудник лаборатории Карла Брэдли в рамках Института энергетической биологии (EBI).

Для идентификации неизвестных вирусов Агиндотан разработал и впервые полностью описал метод, основанный на последовательность-независимой амплификации (SIA) для РНК-вирусов. Метод включает частичную очистку вируса, экстракцию вирусной РНК, случайную амплификацию, клонирование, секвенирование и поиск в базах данных.

"Этот метод имеет преимущество, так как не требует специфических реагентов для целевых вирусов. Вам не нужно заранее знать, какой именно вирус вы ищете", — пояснил исследователь.

Обнаруженный в просе вирус отличается от, но родственен MRFV, который заражает кукурузу в других регионах, но ранее не был зарегистрирован в Иллинойсе. Marafivirus был выявлен на опытном поле университета, где было инфицировано 20–30% растений.

"Мы все еще работаем над идентификацией насекомых-переносчиков. Мы знаем, что родственный MRFV передается цикадками на кукурузе, но для вируса в просе это еще предстоит подтвердить", — сказал Агиндотан.

На данный момент неизвестно, может ли этот вирус поражать другие культуры, а также эволюционное происхождение вирусов проса и кукурузы относительно друг друга.

Это открытие поможет селекционерам в разработке устойчивых сортов биоэнергетических культур, что является приоритетной задачей для предотвращения распространения патогенов на продовольственные культуры. Полная геномная последовательность вируса проса будет опубликована в ближайшее время.