Учёные обнаружили новые штаммы вируса гриппа A у свиней, представляющие потенциальную пандемическую угрозу

Учёные из Медицинской школы Duke-NUS и их коллабораторы выявили несколько ранее неизвестных штаммов вирусов свиного гриппа, которые незаметно циркулировали в популяциях свиней в Камбодже на протяжении последних 15 лет. Штаммы включают вирусы, переданные от людей свиньям, а также вирусы с генами, происходящими из таких отдалённых регионов, как Северная Америка.

Исследование, опубликованное в журнале PNAS, обосновывает необходимость систематического эпиднадзора для раннего обнаружения и предупреждения о новых штаммах вирусов с целью предотвращения будущих пандемий.

Учёные из программы по возникающим инфекционным заболеваниям (EID) под руководством Ивонн Су, Гэвина Смита и Майкла Зеллера выявили генетически разнородные пулы вирусов гриппа A, совместно циркулирующие у свиней.

Свиньи являются ключевым посредником в возникновении и потенциальном распространении вирусов гриппа между животными и людьми, поскольку обеспечивают подходящую среду для перемешивания сегментов генов между птичьими, свиными и человеческими вирусами, что в конечном итоге приводит к появлению новых вирусов. Резкий рост производства свинины за последние 50 лет, международная торговля и перемещение животных дополнительно усилили риски.

Скрытая циркуляция и региональный хотспот

С марта 2020 по июль 2022 года учёные провели эпиднадзор за гриппом свиней на 18 бойнях в Камбодже. Было собрано 4089 назальных мазков от свиней в четырёх провинциях. Из них 72 пробы (около 2%) дали положительный результат на вирус гриппа A.

Было идентифицировано девять различных групп вирусов гриппа A свиней, по крайней мере семь из которых не обнаруживались от 2 до 15 лет. Среди них:

• Несколько линий H3, переданных от людей свиньям и циркулировавших незамеченными около 10 лет.
• Преобладающий подтип H1N1, вероятно, произошедший от вирусов человеческого происхождения, относящихся к пандемии 2009 года.
• Два сезонных вируса в провинциях Кандал, Пномпень и Такео, вероятно, попавшие из Таиланда.
• Новый вариант свиного европейского H1N2 (изначально птичьего происхождения) с североамериканскими генами. Геномный анализ показал, что он циркулировал в регионе с 2014 года.

Трансграничное распространение

Анализ перемещения вирусов через географические границы показал, что европейские свиные вирусы гриппа спорадически завозились в Южный Центральный Китай и Юго-Восточную Азию в начале 2000-х годов. Генетические данные указывают, что с 2010 года Южный Центральный Китай стал основным источником распространения европейских вирусов в регионе, откуда они впоследствии распространились по Китаю и странам ЮВА, включая Камбоджу.

Необходимость систематического эпиднадзора

Хотя свиные вирусы гриппа обычно вызывают у свиней лёгкие симптомы, они представляют пандемическую угрозу для людей, у которых может отсутствовать иммунитет против новых штаммов. Поэтому систематический эпиднадзор критически важен для раннего обнаружения и предупреждения.

Для оценки пандемической угрозы новых вирусов необходимы дальнейшие исследования, в том числе изучение их взаимодействия с человеческими вирусами и способности к распространению. Команда в настоящее время разрабатывает платформу для идентификации основных генетических подтипов свиного гриппа, которая будет включать скрининг не только свиных и человеческих, но и птичьих последовательностей.