Новый нанопорный метод быстрого и точного выявления патогенов у онкобольных

Исследовательская группа под руководством профессора Гу Хунцана из Хэфэйского института физических наук Китайской академии наук разработала новый метод быстрого обнаружения микробов у пациентов с онкологическими заболеваниями. Метод описан в журнале Frontiers in Cellular and Infection Microbiology.

Онкологические пациенты с ослабленным иммунитетом подвержены различным микробным инфекциям и имеют более высокий уровень смертности. Ранняя идентификация микроорганизмов критически важна для своевременного начала противомикробной терапии.

В исследовании учёные собрали образцы (крови и мокроты) у 56 онкобольных с ослабленным иммунитетом и подозрением на инфекцию. Из образцов выделили микробы, создали ампликонные библиотеки для секвенирования и проанализировали их с помощью портативного секвенатора Oxford Nanopore MinION (весом 90 г).

Ключевые результаты:

• Чувствительность нанопорного секвенирования оказалась значительно выше, чем у традиционного культурального метода, как для образцов крови, так и для других типов образцов.
• Новый метод выявил больше случаев бактериальных инфекций, инфекций, вызванных труднокультивируемыми патогенами, и ко-инфекций (одновременного заражения несколькими возбудителями).
• Среднее время получения результата составило около 17,5 часов, что намного быстрее классического культурального анализа.

По словам первого автора работы Гу Хунцана, метод является быстрым и точным для выявления патогенов у иммунокомпрометированных онкобольных. Внедрение этой высокочувствительной технологии может улучшить прогноз для таких пациентов за счёт ускоренной диагностики инфекций и своевременного назначения корректного лечения.