Глобальные рекомендации по улучшению качества микроскопических изображений в научных публикациях

Международная группа из 54 исследователей из более чем 48 институтов мира разработала рекомендации (чек-листы) для публикации микроскопических изображений в научных изданиях. Цель — обеспечить понятность и воспроизводимость биоимиджинговых данных в науках о жизни и медицине. Результаты опубликованы в Nature Methods.

Работа выполнена в рамках глобальной инициативы QUAREP-LiMi (Quality Assessment and Reproducibility for Instruments and Images in Light Microscopy).

Проблема: Ежегодно в науках о жизни и медицине публикуется более миллиона статей, примерно треть содержит изображения (например, микроскопические данные клеток или тканей). Однако большинству этих изображений не хватает ключевой информации (масштаб, метод получения), что мешает их полному пониманию и воспроизведению результатов.

Решение: Рабочая группа QUAREP-LiMi создала конкретные рекомендации для авторов:

• Для изображений: выбор релевантных участков, указание масштаба, именование цветовых каналов в флуоресцентной микроскопии, выбор цветов, различимых для людей с дальтонизмом.
• Для анализа изображений: точное описание использованного ПО и настроек, предоставление выборочных данных для проверки результатов.
• Общее: размещение изображений в общедоступных базах данных для дальнейших исследований.

Критерии в чек-листах разделены на три уровня: минимальные, рекомендуемые и идеальные требования для качественной коммуникации биоимиджинговых данных.

Цель и перспективы:

• Внедрение этих критериев ведущими научными журналами в качестве обязательных стандартов публикации.
• Постоянное обновление чек-листов инициативой QUAREP-LiMi.
• Разработка учебных материалов и тренингов по коммуникации микроскопических изображений.

Ключевая цитата (Кристиан Тишер, EMBL): «Чтобы развивать опубликованные научные результаты, важно, чтобы данные и соответствующие анализы были научно точными, воспроизводимыми и доступными... Наша надежда — создать культуру, где исследования в науках о жизни смогут прогрессировать легче благодаря прозрачности, которая приходит с обменом биоимиджинговыми данными четким и последовательным образом».