Разработан революционный инструмент для анализа клеточных мембран
Междисциплинарная команда из VIB-KU Leuven разработала новый метод анализа микроскопических изображений клеточных мембран — «QuASIMoDOH» (Quantitative Analysis of the Spatial distributions in Images using Mosaic segmentation and Dual parameter Optimization in Histograms). Это первая методика, позволяющая изучать изменения в распределении рецепторов на мембране, вызванные, например, раком или нейродегенеративными заболеваниями. Метод будет опубликован в ведущем журнале PLOS Computational Biology.
Анализ сложности мембран
Инструмент был создан в Bio Imaging Core Leuven, центре VIB, под руководством профессора Себастьяна Мунка. Потребность в нём возникла из-за сложностей с количественной оценкой распределения рецепторов на мембране клетки. Существующие статистические инструменты часто фокусируются только на кластерах белков и липидов.
Ключевое отличие QuASIMoDOH: метод описывает пространственные паттерны мембранных белков и липидов через отклонение от случайного распределения и может анализировать полярные распределения, такие как градиенты. Это позволяет изучать клеточную полярность, изменения которой характерны, например, для прогрессирования рака.
Применение в исследованиях
Изменения в составе мембран вызывают не только рак, но и многие другие заболевания, а также процесс старения. Bio Imaging Core планирует использовать QuASIMoDOH для поддержки исследований в областях от нейробиологии до онкологии, как внутри, так и за пределами VIB-KU Leuven. Метод совместим с различными микроскопическими технологиями и имеет простой вывод данных.
Доктор Геерт Ван Миннебрюгген (VIB) подчеркивает, что инновационные инструменты, подобные этому, — результат объединения технологического и научного опыта. Совместная работа экспертов-технологов и руководителей исследовательских групп в основных центрах VIB становится необходимым условием для научных прорывов.
