Новое ПО для анализа микроРНК открывает путь к персонализированной медицине

Исследователи из Тель-Авивского университета разработали новое программное обеспечение miRNAkey, которое позволяет лучше анализировать данные, полученные с помощью технологии глубокого секвенирования (deep sequencing). Эта технология даёт возможность определять последовательность и экспрессию клеточной ДНК или РНК, включая микроРНК — крошечные молекулы, регулирующие генетический код.

miRNAkey ищет паттерны микроРНК как в здоровых, так и в больных тканях, идентифицирует конкретную молекулу, определяет её уровень и генерирует статистически ценную информацию. До сих пор существовало очень мало унифицированных инструментов для интерпретации данных о микроРНК, и ни один из них не мог работать на локальном компьютере или объяснять неоднозначное поведение микроРНК.

Программа с удобным интерфейсом может использоваться на любом локальном компьютере. Её уникальные функции, такие как статистика данных и подробные отчёты, предоставляют ценную информацию об извлечённых микроРНК.

Практическое применение: от анализа к лечению

«Такая идентификация микроРНК позволяет нам манипулировать ими», — объясняет руководитель исследования доктор Ноам Шомрон.

В одном из исследований его команда смогла идентифицировать соответствующие молекулы микроРНК в агрессивной злокачественной форме рака. Затем они вставили здоровую, неагрессивную форму этих микроРНК в больную, агрессивную молекулу. В модели на животных это привело к значительному замедлению роста опухоли.

Быстрый и корректный анализ данных глубокого секвенирования позволяет глубже изучить поведение болезни и потенциально создать на основе этих знаний специализированные методы лечения, включая «умные лекарства», нацеленные на отдельные повреждённые клетки.

Программный пакет был недавно описан в журнале Bioinformatics.