Микробиом бостонского метро оказался безвредным
Исследование, опубликованное 28 июня в журнале mSystems, показало, что система метро Бостона (известная как "Т") действительно населена бактериями, но в основном это микроорганизмы с нормальной человеческой кожи, не способные вызывать заболевания.
Ключевые выводы:
- Уровни микробов, связанных с устойчивостью к антибиотикам, в метро "намного ниже, чем в нормальном человеческом кишечнике" (Кертис Хаттенхауэр, старший автор исследования).
- Наиболее обильные микробы — это нормальная кожная микрофлора.
- Патогенный потенциал обнаруженной микробиоты очень низок.
Методология:
В 2013 году было собрано около 100 микробных проб с поверхностей вагонов и станций (красная, оранжевая и зелёная линии). Использовались методы 16S ампликонного и shotgun метагеномного секвенирования для профилирования микробных сообществ.
Результаты:
Тип поверхности — главный фактор разнообразия микробов.
- Наибольшее количество ДНК микробов обнаружено на висячих поручнях, затем на сиденьях и сенсорных экранах.
- Пористые поверхности (тканевые поручни) собирают микробы эффективнее, чем твёрдые (металлические шесты).
Доминирующая микрофлора:
- Бактериальные филумы Firmicutes, Proteobacteria и Actinobacteria составляли более 20% сообщества каждый.
- Самый распространённый вид — кожная бактерия Propionibacterium acnes.
- Уровни кишечных и оральных микробов (например, Lachnospiraceae, Veillonella, Prevotella) были низкими.
Влияние локации:
- На микробиом билетных автоматов влияла среда: у уличных станций преобладали Alphaproteobacteria, у подземных — Corynebacterium и Tissierellaceae, у крытых — Acinetobacter.
Отсутствие угрозы:
- Между линиями метро или станциями в разных районах была минимальная разница в микробиоме.
- Обнаружено минимальное количество потенциально патогенных микробов или генов устойчивости к антибиотикам.
Перспективы:
Требуются дальнейшие исследования, чтобы определить, являются ли обнаруженные микробы активными или покоящимися, и как они передаются между людьми. Планируется изучить, происходят ли микробы от живых или мёртвых организмов.