Сохранённые лягушки помогли проследить историю смертельного патогена

Аспирантка Йельского университета разработала новый метод для изучения истории патогена, смертельно опасного для земноводных по всему миру.

Кэти Ричардс-Хрдличка, докторант Йельской школы лесного хозяйства и экологических исследований, исследовала 164 законсервированных земноводных на наличие Batrachochytrium dendrobatidis (Bd) — инфекционного патогена, ведущего многие виды к вымиранию. Патоген обнаружен на всех континентах, где обитают земноводные, и у более чем 200 видов. Bd вызывает хитридиомикоз — одно из самых разрушительных инфекционных заболеваний среди диких позвоночных.

Её статья "Извлечение хитридиевого грибка амфибий из фиксированных формалином образцов" опубликована в журнале Британского экологического общества Methods in Ecology and Evolution.

Ричардс-Хрдличка взяла мазки с кожи 10 видов земноводных, датируемых 1963 годом и законсервированных в формалине в Музее естественной истории Пибоди. Затем эти мазки были проанализированы на наличие смертельного патогена.

Образцы анализировали с помощью высокочувствительного молекулярного теста — количественной полимеразной цепной реакции (qPCR), который может обнаружить ДНК Bd даже у образцов, изначально фиксированных формалином. Формалин давно известен как мощный химикат, разрушающий ДНК.

Этот прогресс открывает возможности для выяснения даты и места появления Bd в глобальном или региональном масштабе, а также может помочь определить, связаны ли некоторые недавние вымирания или исчезновения с Bd. Учёные также смогут выявить более глубокие молекулярные паттерны патогена, такие как генетические изменения и закономерности, связанные с различиями штаммов, уровнями вирулентности и популяционной генетикой.

Ричардс-Хрдличка обнаружила Bd в шести образцах из Гилфорда, Коннектикут, датируемых 1968 годом — это самое раннее свидетельство присутствия Bd на северо-востоке США. Четыре других заражённых животных 1960-х годов происходили из Хэмдена, Личфилда и Вудбриджа. Среди образцов, собранных в 2000-х годах, 27 заражённых Bd были из Вудбриджа и южного Коннектикута. В других связанных работах она обнаружила, что сегодня почти 30% земноводных в Коннектикуте заражены, но не проявляют внешних признаков инфекции.

Популяции и виды земноводных по всему миру сокращаются или исчезают из-за изменения землепользования, потери среды обитания, изменения климата и болезней. Хитридиевый грибок, вызываемый Bd, убивает земноводных, препятствуя их кожному дыханию. С момента идентификации Bd в конце 1990-х годов ведётся межконтинентальная работа по документированию заражённых им популяций и видов земноводных. Работа Ричардс-Хрдлички позволит исследователям заглянуть в прошлое для получения дополнительной информации о влиянии этого патогена.