Новые типы и классы грибов, выявленные с помощью длинных прочтений eDNA

Недавние достижения в методах секвенирования длинных прочтений позволили получить большой объём высококачественных данных по гену-маркеру рРНК об эукариотических организмах. Однако многие из этих таксонов оставались неизвестными на высших таксономических уровнях: тип и царство. В результате тщательного анализа базы данных длинных прочтений EUKARYOME международная группа под руководством профессора Лехо Тедерсоо (Тартуский университет, Эстония) обнаружила, что значительная часть неизвестных эукариот принадлежит к глубоким, ранее не описанным грибным линиям.

Разработав инновационные подходы в таксономии и проведя строгий филогенетический анализ, исследователи описали 30 новых грибных линий от уровня порядка до типа, включая типовые виды этих групп. Свою работу они опубликовали в журнале MycoKeys.

Названия новых таксонов были разработаны и утверждены всеми соавторами. Имена отсылают к типовой местности с использованием корней местных языков (америндских, саамского, эстонского). Авторы также предложили таксономические термины "нуклеотип" и "легитип" для обозначения ДНК-образцов и ДНК-последовательностей, полученных от голотипа, соответственно. При определённых обстоятельствах (например, при утрате голотипа) они также могут использоваться в качестве типов.

Таксономический подход, разработанный Тедерсоо и коллегами, предоставляет способ описания и систематизации невидимых, потенциально некультивируемых микроэукариотических таксонов.