Исследования в геномике по-прежнему сосредоточены на «харизматичных» организмах

Спустя десятилетия после геномной революции половина известных линий эукариот всё ещё не изучена на геномном уровне. В этой области сохраняется предвзятость в пользу «более популярных» организмов в ущерб потенциально богатым генетически одноклеточным формам.

Согласно масштабному анализу текущих геномных проектов, проведённому исследователями из Университета Британской Колумбии (UBC), недостаточное внимание к микробным эукариотам оставляет нераскрытым огромный генетический потенциал. Результаты опубликованы в майском номере журнала Trends in Ecology and Evolution.

«Мы по-прежнему в основном анализируем одни и те же хорошо известные группы эукариот: животных, грибы и растения. Во многом потому, что их польза более очевидна, они ближе к нам как людям и, откровенно говоря, потому что мы можем видеть их невооружённым глазом», — отмечает ведущий автор статьи Хавьер дель Кампо.

«Но с точки зрения биологического разнообразия и геномики этот антропоцентричный подход нерелевантен и потенциально сдерживает нас. Мы упускаем возможность изучить бо́льшую часть эукариотического разнообразия планеты, а значит, и целый спектр альтернативных жизненных стратегий, новых метаболических путей и функций генов».

Авторы призывают к более широкой, объективной инициативе по секвенированию геномов микробных эукариот, основанной на родственных связях видов, чтобы охватить всё разнообразие этих организмов.

Результаты анализа

Учёные проанализировали все текущие или планируемые геномные исследовательские проекты и обнаружили, что 51% известных эукариотических линий до сих пор не представлены и не изучены на геномном уровне.

Содержимое геномных баз данных сильно смещено в сторону сложных одноклеточных организмов, в особенности линий Rhizaria, Amoebozoa и гетеротрофных Stramenopiles.

Анализ пяти крупнейших коллекций культур эукариот показал, что до 25% описанных эукариотических линий не имеют представителей в культуре.