Исследование гигантских вирусов меняет древо жизни

Новое исследование гигантских вирусов поддерживает идею, что вирусы — древние живые организмы, а не неодушевлённые молекулярные остатки, вышедшие из-под контроля, как утверждали некоторые учёные. Исследование перестраивает универсальное древо жизни, добавляя четвёртую крупную ветвь к трём, которые, по мнению большинства учёных, представляют фундаментальные домены жизни.

Результаты опубликованы в журнале BMC Evolutionary Biology.

Исследователи использовали относительно новый метод, чтобы заглянуть в далёкое прошлое. Вместо сравнения генетических последовательностей, которые нестабильны и быстро меняются со временем, они искали свидетельства прошлых событий в трёхмерных структурных доменах белков. Эти структурные мотивы, называемые фолдами, — относительно стабильные молекулярные окаменелости, которые, подобно окаменелостям костей, дают ключи к древним эволюционным событиям.

Учёные провели перепись всех белковых фолдов, встречающихся более чем у 1000 организмов, представляющих бактерии, вирусы, археи и все другие живые существа. Гигантские вирусы были включены, потому что они велики и сложны, а их геномы сопоставимы с геномами простейших бактерий или даже превосходят их.

В новом исследовании учёные построили новое универсальное древо жизни, включив вирусы. Получившееся древо имело четыре чётко дифференцированные ветви, каждая из которых представляла отдельную «супергруппу»:

Исследователи обнаружили, что многие из самых древних белковых фолдов, встречающихся у большинства клеточных организмов, присутствуют и у гигантских вирусов. Это указывает, что эти вирусы появились очень рано в эволюции, близко к корню древа жизни.

Анализ также добавляет доказательств тому, что гигантские вирусы изначально были гораздо сложнее и со временем претерпели драматическое сокращение своих геномов. Это сокращение, вероятно, объясняет их eventual adoption of a parasitic lifestyle. Вирусы также оказались ключевыми «распространителями информации», так как белковые структуры, которые другие организмы разделяют с вирусами, имеют более широкое распространение.

Исследование предлагает дополнительные доказательства того, что вирусы вплетены в саму ткань жизни.