Исследование популяционно-генетических характеристик двух гибридных линий карася
Карась (Carassius auratus) — распространённый в Китае вид пресноводных рыб, аквакультура которого зависит от искусственной селекции. Гибридная линия, полученная от скрещивания Carassius cuvieri (♀) × C. auratus red var. (♂) (HFJ), и новая гомодиплоидная карасеподобная линия, полученная от Cyprinus carpio (♀) × Megalobrama amblycephala (♂) (NCRC), являются важными источниками генетического материала.
Исследование, опубликованное в Reproduction and Breeding, изучило популяционные характеристики этих двух гибридных линий с использованием ядерного генного маркера — трансферрина (Tf).
Учёные отобрали для анализа популяции HFJ, NCRC и четыре другие популяции карася, проанализировали их генетический полиморфизм и структуру и получили новые данные, отличающиеся от результатов, полученных с митохондриальными маркерами.
«Оценка генетического разнообразия — важное звено в сохранении и исследовании генетических ресурсов», — поясняет автор-корреспондент Конгхуэй Ян из Государственной ключевой лаборатории биологии развития пресноводных рыб Хунаньского педагогического университета.
Ранее, используя данные митохондриального гена COI и D-петли, команда обнаружила, что культивируемые популяции демонстрируют относительно низкие уровни гаплотипического и нуклеотидного разнообразия по сравнению с дикими.
Однако в данном исследовании учёные наблюдали, что нуклеотидное разнообразие диких популяций было ниже, чем у культивируемых, что противоречит предыдущему выводу, основанному на митохондриальных генах.
«Эти новые данные предполагают потенциальную корреляцию между высоким генетическим разнообразием аллелей Tf у культивируемых популяций Carassius и их гибридным происхождением. Мы предполагаем, что высокий полиморфизм ядерного гена у HFJ и NCRC может способствовать их высокой устойчивости к стрессу и инфекциям», — говорит Ян.
Анализ родственных связей между шестью популяциями карася не выявил чёткой популяционной структуры между дикими и культивируемыми линиями по аллелям Tf, что проявилось в их явном смешанном распределении.
Ян подчёркивает гибридные генетические характеристики HFJ и NCRC.
«Отсутствие явного генетического расхождения может быть связано со сложным генетическим фоном и геномной нестабильностью гибридных разновидностей HFJ и NCRC. Тем не менее, это исследование предоставляет прямые доказательства, основанные на данных ядерного маркера, гибридных генетических характеристик двух гибридных линий», — отмечает она.