Карповые геномы раскрывают видообразование и хромосомную эволюцию рыб

В исследовании, опубликованном в Molecular Ecology Resources, международная команда под руководством профессора Хэ Шуньпина из Института гидробиологии Китайской академии наук изучила эволюционную историю восточноазиатских карповых, а также эволюцию и видообразование толстолобика и белого амура.

Используя короткие чтения и генетические карты, ученые представили высококачественные сборки геномов толстолобика и белого амура на уровне хромосом.

Ключевые открытия:

• Хромосомная перестройка: У восточноазиатских карповых произошло специфическое слияние хромосом примерно 9.2 млн лет после того, как эта ветвь отделилась от линии, содержащей обыкновенного карпа и Sinocyclocheilus. Это объясняет, почему у этих рыб только 24 пары хромосом.
• Время расхождения: Толстолобик и белый амур образуют общую кладу. Их эволюционные пути разошлись около 3.6 млн лет назад.
• Генетическая дифференциация и интрогрессия: Несмотря на высокую степень генетического различия между видами, анализ популяций выявил признаки интрогрессии (обмена генами) между ними.
• Гены видообразования: Гены в расходящихся регионах генома связаны с развитием репродуктивной системы и первичных женских половых признаков. Эти регионы могут влиять на раннее видообразование, репродуктивную изоляцию и адаптацию к среде.

"Эти геномные данные являются важным ресурсом для дальнейшего изучения эволюции, сохранения и коммерческого разведения восточноазиатских карповых", — отметил Ян Ляньдун из команды профессора Хэ.