Генетические инструменты дополняют визуальную идентификацию исчезающих рыб
Генетические инструменты могут быть мощным дополнением к визуальной идентификации исчезающих рыб, показывает исследование Калифорнийского университета в Дэвисе.
В исследовании, опубликованном в журнале Conservation Genetics, учёные провели генетический анализ образцов плавников исчезающей дельтовой корюшки (delta smelt), находящейся под угрозой длиннопёрой корюшки (longfin smelt) и инвазивной вакасаги (wakasagi smelt). Образцы были собраны в рамках программы мониторинга рыб Yolo Bypass Fish Monitoring.
Одна треть была идентифицирована неверно
Учёные искали признаки гибридизации, но обнаружили, что она не представляет значительной угрозы для этой популяции дельтовой корюшки. Однако генетический анализ выявил неожиданный результат: около 27% рыб, изначально принятых за местную дельтовую корюшку в Yolo Bypass, оказались неродной вакасаги. В целом, примерно треть образцов была идентифицирована неверно.
Соавторы подчёркивают, что это была выборка из одного участка ареала дельтовой корюшки. Результаты не означают, что общая численность дельтовой корюшки ниже, чем считалось ранее. Соавтор Брайан Махарджа из Калифорнийского департамента водных ресурсов отметил, что за первые 10 лет отбора проб в Bypass программа мониторинга почти не вылавливала дельтовую корюшку, но за последние пять лет её вылавливали больше, чем когда-либо.
«Результаты этого исследования не меняют долгосрочных тенденций численности дельтовой корюшки в Yolo Bypass, но они означают, что нам необходимо проводить генетическую идентификацию рыб для повышения точности», — сказал Махарджа.
Дополнение к традиционным обследованиям
Дельтовая и длиннопёрая корюшка являются аборигенными видами для эстуария Сан-Франциско, но в последние годы их популяции резко сократились. Последнее обследование рыб в дельте Сакраменто-Сан-Хоакин обнаружило только две дельтовые корюшки за четыре месяца траления с сентября по декабрь.
Попытки защитить дельтовую корюшку сделали её объектом споров между защитниками окружающей среды и группами, заинтересованными в увеличении водоподачи для сельского хозяйства и городов. Обследования численности местных рыб влияют на управленческие решения и приводят к изменениям в политике, затрагивающим миллионы калифорнийцев.
«Генетическая идентификация может стать отличным дополнением к традиционным обследованиям, особенно там, где визуальная идентификация затруднена», — сказала ведущий автор Алисса Бенджамин, лаборант кафедры зоотехники Калифорнийского университета в Дэвисе.
Молодых корюшек сложнее идентифицировать
Исследование демонстрирует сложность идентификации этих рыб только по внешнему виду. Дельтовая, длиннопёрая корюшки и вакасаги имеют схожие черты и способны к гибридизации друг с другом. Хотя три вида можно отличить визуально, гибридов почти невозможно определить только по внешнему виду.
Вакасаги представляют дополнительные сложности. В ювенильном возрасте вакасаги могут выглядеть идентично дельтовой корюшке. Ключевая отличительная черта — у вакасаги под челюстью появляется несколько пятен, которых нет у дельтовой корюшки. Однако эти пятна, как правило, появляются только у более взрослых особей, что затрудняет идентификацию молоди. Фактически, 95% ошибочно идентифицированных рыб были молодыми особями.
Не все районы были проанализированы
Дельтовая корюшка обитает только в заливе Сан-Франциско и дельте Сакраменто-Сан-Хоакин, которая включает Yolo Bypass — 59 000-акровый паводковый канал, защищающий Сакраменто и южную часть долины Сакраменто от сезонных наводнений.
Исследователи отмечают, что в исследовании не анализировались все районы, где проводятся обследования дельтовой корюшки. Ошибочная идентификация наиболее вероятна в районах, где присутствуют как дельтовая корюшка, так и вакасаги. Это включает Yolo Bypass, но, как ожидается, не распространяется на весь эстуарий.
Программа мониторинга рыб Yolo Bypass также использует уникальную роторную винтовую ловушку, которую проверяют один раз в день. Некоторые рыбы к моменту проверки ловушки биологами находятся на разных стадиях разложения, что может затруднить идентификацию.
«Многие факторы, влияющие на идентификацию, характерны именно для этого района Yolo Bypass, — сказала Бенджамин. — Я думаю, что в других районах дельты точность будет выше, поэтому нам нужно изучить эти районы, прежде чем делать какие-либо предположения об остальной части эстуария».