Скрыто в наших генах: открытие судьбы развития клеток

По мере развития клеток изменения во взаимодействии генов определяют их судьбу. Различия в этих генетических взаимодействиях могут сделать наши клетки устойчивыми к вирусной инфекции или позволить иммунным клеткам уничтожать раковые.

Понимание того, как работают эти ассоциации генов в процессе развития тканей и органов человека, важно для создания методов лечения сложных заболеваний, от рака до пороков развития и болезней сердца.

Новая технология single-cell RNA-sequencing позволила изучать поведение генов в клетках человека и млекопитающих с беспрецедентным разрешением и обещает ускорить научные и медицинские открытия.

Совместно с международными коллабораторами из Китая, США и Великобритании ученые Сиднейского университета разработали аналитический подход для этой одноклеточной секвенации, который способен выявлять широкие изменения в поведении генов внутри ткани человека. Метод назвали single-cell higher-order testing (scHOT).

В статье, опубликованной в Nature Methods, команда продемонстрировала эффективность метода, идентифицировав гены у мышей, изменчивость которых меняется в клетках в процессе эмбрионального развития печени.

Под руководством профессора Джин Янг из Школы математики и статистики команда также обнаружила новые пары генов, чья экспрессия изменяется согласованно в обонятельной луковице мыши — важной ткани для понимания нейроразвивающих заболеваний.

Эти результаты иллюстрируют scHOT как мощный новый инструмент, который раскроет скрытые ассоциации генов в наших клетках и позволит полностью использовать потенциал передовых одноклеточных технологий для важных биологических открытий.

Это исследование поможет выявить скрытые генетические взаимодействия в клетках, предоставив новый способ видеть и описывать биологическую сложность.