Генетические связи между признаками часто переоцениваются
Многие оценки того, насколько сильно признаки и заболевания связаны общими генетическими сигналами, могут быть завышены. Новое исследование под руководством UCLA показывает, что текущие методы оценки генетических взаимосвязей между признаками не учитывают модели формирования пар.
Ученые, используя мощные технологии секвенирования генома, стремятся понять генетические ассоциации между признаками и риском заболеваний, надеясь, что открытия общих генетических основ подскажут пути борьбы с болезнями. Однако новое исследование, опубликованное 17 ноября в Science, предостерегает от излишней опоры на оценки генетической корреляции. По мнению авторов, такие оценки искажены небиологическими факторами в большей степени, чем считалось ранее.
Оценки генетической корреляции обычно предполагают случайность формирования пар. Но в реальности партнеры часто объединяются из-за общих интересов и социальных структур. В результате некоторые генетические корреляции, обнаруженные в предыдущих работах и приписываемые общей биологии, могут вместо этого отражать некорректные статистические допущения. Например, предыдущие оценки генетического перекрытия между индексом массы тела (BMI) и уровнем образования, вероятно, отражают именно этот тип популяционной структуры, вызванный "кросс-признаковым ассортативным скрещиванием" — тенденцией индивидов с одним признаком объединяться в пары с индивидами, обладающими другим признаком.
Авторы подчеркивают, что оценки генетической корреляции заслуживают более тщательной проверки, поскольку они используются для прогнозирования риска заболеваний, поиска подсказок для потенциальной терапии, информирования диагностической практики и формирования аргументов о поведении человека и социальных проблемах. Некоторые в научном сообществе делали излишний акцент на этих оценках, исходя из идеи, что изучение генов, поскольку они неизменны, может преодолеть смешивающие факторы.
"Если вы просто видите два признака, которые часто встречаются вместе у группы людей, вы не можете сделать вывод, что они связаны по одной и той же причине. Но существовало предположение, что если можно проследить это до генов, то вы получите причинно-следственную историю", — говорит ведущий автор Ричард Бордер.
На основе анализа двух крупных баз данных о признаках супругов исследователи обнаружили, что кросс-признаковое ассортативное скрещивание сильно связано с оценками генетической корреляции и, вероятно, объясняет "существенную" их часть.
"Кросс-признаковое ассортативное скрещивание затронуло все наши геномы и вызвало интересные корреляции между ДНК, унаследованной от матери, и ДНК, унаследованной от отца, по всему геному", — отмечает соавтор Ноа Зайтлен.
Исследователи также изучили оценки генетической корреляции для психических расстройств, которые вызывают споры в психиатрическом сообществе, поскольку демонстрируют генетические связи между расстройствами, казалось бы, мало похожими, например, СДВГ и шизофренией. Анализ показал, что генетические корреляции для ряда несвязанных признаков могут быть правдоподобно объяснены кросс-признаковым ассортативным скрещиванием и несовершенством диагностических практик. С другой стороны, анализ выявил более сильные связи для некоторых пар признаков, таких как тревожные расстройства и большое депрессивное расстройство, что указывает на действительно существующую общую биологию.
"Но даже когда реальный сигнал есть, мы все равно считаем, что переоцениваем степень этого совпадения", — заключает Бордер.