Ученые раскрыли причину массовой гибели красных морских ушек с помощью "геномной криминалистики"

В августе 2011 года тысячи погибших красных морских ушек (Haliotis rufescens) были выброшены на побережье округа Сонома в Северной Калифорнии. Ученые, включая биолога из Калифорнийского университета в Дэвисе, установили, что причиной стал вредоносный цветение водорослей, вырабатывающих иессотоксин.

Метод исследования, описанный в журнале Nature Communications, может изменить подход к расследованию случаев массовой гибели диких животных. Новый подход, названный "судебной (или криминалистической) геномикой", сочетает полевые наблюдения, тестирование на токсины и полногеномное сканирование.

Ключевую роль сыграла удачная временная привязка: за несколько месяцев до события ученые секвенировали полный геном нескольких красных морских ушек в том же районе.

"По сути, у нас была базовая линия. После гибели мы вернулись на тот же участок и провели полногеномное сканирование выживших особей", — пояснила соавтор исследования Лора Роджерс-Беннетт.

Сравнив два набора данных с помощью компьютерной программы, ученые обнаружили значимые различия в определенных участках генома. Исследование этих "выбросов" показало, что они связаны с функцией детоксикации.

Результаты подтвердили гипотезу о том, что причиной массовой гибели стал именно иессотоксин от цветения водорослей, а не воздействие других потенциальных токсинов.

"Наша методика имеет широкую применимость и может быть полезна для выявления причин других случаев гибели диких животных. Мы никогда бы не смогли этого сделать, если бы заранее не провели полное сканирование всего генома", — отметила Роджерс-Беннетт.

Исследование демонстрирует ценность сбора базовых генетических данных о диких популяциях до наступления неблагоприятных событий, даже если образцы остаются замороженными "на будущее".