Расшифрован геном самого маленького известного грибного фитопатогена

Ученые секвенировали и проанализировали геном гриба Mixia osmundea — самого маленького известного грибного фитопатогена (13,6 млн пар оснований). Исследование проливает свет на механизмы его патогенности и репродуктивной биологии.

Помимо изучения размножения патогена, аннотация генома выявила его способности к расщеплению компонентов клеточной стенки растений, что представляет интерес для исследователей в области биоэнергетики.

Гриб, впервые описанный 100 лет назад, встречается редко и был изолирован только на листьях двух видов папоротников в Японии, Тайване и Америке. Его геном был секвенирован и аннотирован в рамках проекта по изучению древа жизни грибов, а данные стали доступны на портале MycoCosm Объединенного института геномики Министерства энергетики США (DOE JGI).

Анализ показал, что M. osmundea обладает несколькими углевод-активными ферментами, что подтверждает его способность разрушать растительную биомассу. В частности, обнаружены множественные копии фермента, указывающие на особую эффективность в расщеплении одного из соединений клеточной стенки.

Однако в геноме не найдены гены, необходимые для расщепления ксилана или превращения целлобиозы в глюкозу. Таким образом, хотя у M. osmundea есть набор ферментов для разрушения целлюлозы, у него отсутствуют ферментные системы для её полной деполимеризации до простых сахаров.