Расшифрован геном Amborella с использованием материала из дендрария UCSC

Тропический кустарник Amborella trichopoda — это утконос растительного мира, единственный выживший представитель самой ранней ветви на генеалогическом древе цветковых растений. Учёные расшифровали полный геном Amborella, получив новые данные об эволюции цветковых. Дендрарий Калифорнийского университета в Санта-Крузе (UCSC Arboretum) сыграл ключевую роль в этой работе, предоставляя растительный материал из своей коллекции исследователям проекта на протяжении нескольких лет.

Amborella была добавлена в коллекцию дендрария UCSC в первые годы его работы как часть небольшого собрания потенциально «примитивных цветковых растений». В 1975 году, под руководством основателя дендрария Рэя Коллетта, два студента UCSC, Вирджиния и Тодд Килер-Вульф, собрали образцы Amborella в Новой Каледонии и отправили их в дендрарий. В начале 1980-х три других студента UCSC — Бетти О’Доннелл, Дженни Уордрип (Келлер) и Антье Павлик — изучали Amborella как возможную связь с древними цветковыми растениями в рамках студенческого исследовательского проекта, который, возможно, опередил своё время.

Чарльз Дарвин называл внезапное появление цветковых растений в палеонтологической летописи «отвратительной тайной». Из-за скудных ископаемых свидетельств учёные не могли проникнуть в эту тайну, пока новые технологии молекулярной генетики не позволили им найти ключи в ДНК живых растений. В конце 1990-х исследователи из других учреждений изучили ДНК Amborella и широкого спектра других растений и определили, что Amborella является «самым примитивным» из ныне живущих цветковых растений. В то время дендрарий UCSC был единственным источником образцов Amborella в США.

Позднее Amborella Genome Group использовала растительный материал из дендрария и других учреждений для секвенирования полного генома (всего генетического кода растения). Было обнаружено, что, помимо того что Amborella является сестринской группой для всех цветковых растений, она включила генетический материал из зелёных водорослей, мхов и других цветковых растений в свою митохондриальную ДНК. Дендрарий делился растительным материалом с несколькими исследователями, ответственными за эту работу, включая Клода де Памфилиса из Университета штата Пенсильвания, а также Дугласа и Памелу Солтис и Сангтэ Кима из Университета Флориды.

С момента первой публикации об этом исследовании в 1999 году Amborella фигурирует в большинстве учебников по биологии для колледжей вместе с фотографиями растений из дендрария. Часть телевизионного спецвыпуска NOVA «Первый цветок» была снята в дендрарии. Фотографии растений, сделанные сотрудниками дендрария, также появлялись в планетариях Калифорнийской академии наук и Национального ботанического сада в шоу о жизни на Земле, а также в широко перепечатанной статье журнала Science о происхождении цветковых растений.

2014-02-06