Расшифровка генетического разнообразия риса
Рис — самая важная продовольственная культура в мире. Понимание его ценного генетического разнообразия и использование его для выведения новых сортов станет основой для улучшения производства риса в будущем и обеспечения глобальной продовольственной безопасности.
Международная исследовательская группа проанализировала геномы двадцати различных типов генетически разнообразного риса, используемого в международной селекции и обладающего широким спектром характеристик. Результаты опубликованы в Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS).
«Мы искали фрагменты ДНК, которые отличают каждый тип риса, — говорит доктор Кен МакНалли из Международного научно-исследовательского института риса (IRRI). — Если у типов риса есть общий благоприятный признак, например, засухоустойчивость, высокая урожайность или даже желаемые кулинарные качества, вероятно, у них также будет одинаковая вариация ДНК, ответственная за этот признак».
Рис содержит десятки тысяч генов, поэтому поиск эффективного способа их анализа стал крупным прорывом. IRRI поддерживает Международный генный банк риса, содержащий более 109 000 типов риса, однако относительно немногие из них использовались в селекционных программах.
Генеральный директор IRRI доктор Роберт Цайглер отмечает: «Если селекционеры будут больше знать о генетическом составе риса, они смогут использовать его более эффективно. Поскольку мы сталкиваемся с более непредсказуемыми изменениями климата, мы будем всё больше полагаться на неиспользованное разнообразие риса для разработки новых и улучшенных сортов».
Это исследование представляет собой значительное международное сотрудничество с участием учёных из стран Азии, Северной Америки и Европы. Работа объединила исследователей, интересующихся как фундаментальной, так и прикладной наукой — от эволюции и доместикации сельскохозяйственных культур до практической селекции.
Соавтор исследования, профессор Университета штата Колорадо доктор Ян Лич указывает, что «исчерпывающая информация о SNP позволяет исследовать разнообразие риса не только для понимания того, как функционируют гены в растущем и развивающемся растении, но и для улучшения важных признаков риса, связанных с устойчивостью к болезням, засухоустойчивостью, повышением продуктивности и пользой для здоровья человека». Директор Института молекулярной биологии Общества Макса Планка и участник проекта Детлеф Вайгель согласен: «Эта работа закладывает основу для следующего этапа раскрытия сокровищницы генетического разнообразия, доступной в IRRI и других центрах селекции риса».
Источник: Kenneth L. McNally et al., Genomewide SNP variation reveals relationships among landraces and modern varieties of rice, PNAS, Published online before print July 13, 2009, doi: 10.1073/pnas.0900992106
