Новые данные об эволюции экспрессии генов
Экспрессия тысяч генов определяет идентичность и функции органов позвоночных. Её эволюция играет центральную роль в эволюции организмов. Крупные эволюционные изменения, такие как развитие мозга гоминоидов, связаны со сдвигами в экспрессии генов. Однако эволюционная динамика паттернов экспрессии с дупликацией генов и без неё остаётся плохо изученной.
«Важный вопрос: предрасполагает ли длительная экспрессия в одном органе гены к последующему использованию в других органах. Ответ — да», — говорит доктор Кенджи Фукусима из Вюрцбургского университета. «Существуют преадаптивные склонности в эволюции экспрессии генов позвоночных, и эта склонность варьируется в зависимости от наличия и типа дупликации генов».
Фукусима и его соавтор Дэвид Д. Поллок сообщают об этих и других выводах в журнале Nature Communications.
Сложная история генеалогических деревьев генов
Для исследования учёные объединили 1903 набора данных RNA-seq из 182 исследовательских проектов. Данные включают шесть органов (мозг, сердце, почки, печень, яичники и семенники) от 21 вида позвоночных — от пресноводных рыб и лягушек до ящериц, птиц, грызунов и человека. Это позволило выявить сложную историю генеалогических деревьев генов и проанализировать эволюцию экспрессии широкого набора генов.