Использование eДНК для мониторинга популяций исчезающих видов

Сокращение популяции местной рыбы Rhodeus atremius suigensis (горчака) в бассейне реки Асида (Япония) вызывает опасения, так как этот вид является индикатором для сохранения биоразнообразия пресноводных экосистем.

Традиционные полевые исследования для охраны фауны требуют много времени и ресурсов. Альтернативой служит анализ экологической ДНК (eDNA) — генетического материала, оставляемого организмами в окружающей среде. Этот неинвазивный метод позволяет эффективно определять присутствие видов.

Ученые из Университета Окаямы применили полуколичественный анализ eDNA с помощью ПЦР (полимеразной цепной реакции) для оценки не только наличия, но и распределения и плотности популяции R. a. suigensis. Они разработали специфичные праймеры для участка митохондриальной ДНК этого вида.

"Мы сначала подтвердили эффективность анализа в аквариумных экспериментах, прежде чем проводить полевые исследования", — говорит профессор Кадзуёси Наката.

В полевых условиях ловушки установили в 48 точках сельскохозяйственного канала в бассейне реки Асида. Исследователи обнаружили, что концентрация eDNA снижается с увеличением расстояния вниз по течению от точки отлова рыбы.

"Наши результаты служат ориентиром для будущих исследований по сохранению видов", — отмечает профессор Наката.

Метод подтвердил, что концентрация eDNA отражает распространение и численность R. a. suigensis. Технология требует только отбора проб воды, что позволяет привлекать к мониторингу местных жителей.

Метод масштабируем для больших территорий и, с разработкой специфичных праймеров, может быть адаптирован для других исчезающих видов. Это способствует не только сохранению видов, но и повышению осведомленности о важности биоразнообразия с участием местных сообществ.