Усовершенствованный метод ДНК-анализа отслеживает местные и инвазивные виды рыб

Учёные могут использовать фрагменты ДНК, взвешенные в воде, для каталогизации инвазивных или местных видов, вместо проведения переписи с помощью сетей.

Исследование Корнеллского университета, Университета Нотр-Дам и Гавайского Тихоокеанского университета опубликовано 14 июля в Methods in Ecology and Evolution.

Суть метода

Метод основан на анализе экологической ДНК (eDNA). Учёные берут небольшой образец воды из водоёма. Рыбы оставляют в воде следы клеток, содержащих целые митохондриальные геномы. С помощью технологии ПЦР (полимеразной цепной реакции), которая создаёт миллиарды копий ДНК для изучения, можно собрать данные о местообитаниях рыб без их отлова.

Прорыв в качестве данных

Ранее считалось, что ДНК рыб, извлечённая из воды, имеет низкое качество и сильно деградирована. Новое исследование впервые показало обратное: в водотоках остаются крупные, неповреждённые цепочки рыбьей ДНК.

Практическое применение

• Точная идентификация: Метод позволяет получить генетические детали вида, а не просто констатировать его присутствие. Это приближает технологию к работе криминалистов, которые определяют каких именно людей было на месте преступления.
• Борьба с инвазивными видами: Например, для азиатских карпов в каналах Чикаго теперь можно не только подтвердить их наличие, но и приблизиться к пониманию их количества, генетических различий между особями и потенциального источника. Это помогает оценить угрозу и принять меры по изоляции источника инвазии.
• Сохранение видов: Технология помогает лучше разрабатывать меры по искоренению инвазивных видов или спасению и восстановлению исчезающих. Раннее обнаружение инвазии может позволить уничтожить популяцию и предотвратить её распространение.

Дэвид Лодж, старший автор: «Мы усовершенствовали инструмент eDNA, чтобы, если в реке или озере есть угрожаемые, исчезающие или инвазивные виды, мы могли установить генетические детали присутствующих там видов».