Источники E. coli не всегда очевидны

Учёные из Министерства сельского хозяйства США (USDA) выявили источники бактерий Escherichia coli, что может помочь восстановить репутацию местного животноводства. Исследования учёного из Службы сельскохозяйственных исследований (ARS) Марка Ибекве показывают, что в некоторых районах Калифорнии патогены в местных водоёмах чаще попадают туда со стоком из городских районов, а не с животноводческих ферм.

ARS — главное внутриведомственное научно-исследовательское агентство USDA, и эта работа соответствует приоритету USDA по обеспечению безопасности пищевых продуктов.

Хотя большинство штаммов E. coli не являются патогенными, эту бактерию отслеживают органы общественного здравоохранения как индикатор качества воды. Коров часто считают виновниками, когда E. coli обнаруживают в местных озёрах, реках и других водоёмах.

Ибекве, работающий в Лаборатории засоления ARS в Риверсайде (Калифорния), и его коллеги собрали 450 проб воды и донных отложений с 20 участков в бассейне реки Санта-Ана в центральной Калифорнии. Места сбора включали городские районы, зоны кормления скота, парки, земли национального леса и три завода по очистке сточных вод.

Затем учёные выделили E. coli из каждой пробы и идентифицировали 600 различных изолятов E. coli, многие из которых можно было отнести к шести клональным популяциям. Наибольшее разнообразие типов E. coli было обнаружено в стоках с территорий, где преобладает городская застройка или деятельность человека.

Ибекве также протестировал все изоляты E. coli на устойчивость к различным антибиотикам. Он обнаружил, что от 88 до 95% изолятов были устойчивы к рифампицину, а около 75% — к тетрациклину. Устойчивость к тетрациклину была безусловно наиболее распространённым типом резистентности у изолятов E. coli, собранных вблизи очистных сооружений.

Учёные также выяснили, что 24% E. coli, собранных в пробах донных отложений городских стоков (всего 144 изолята), показали устойчивость к семи антибиотикам одновременно. Результаты этой работы были опубликованы в журнале PLOS ONE.