В ДНК человека обнаружены новые древние вирусы
Между генами человека обнаружены 19 новых фрагментов нечеловеческой ДНК, оставленных вирусами, которые инфицировали наших предков сотни тысяч лет назад. Один из этих участков, найденный примерно у 50 из 2500 изученных людей, содержит интактный, полный генетический код целого вируса (провируса). Пока неизвестно, может ли он реплицироваться.
Учёные также подтвердили 17 других фрагментов вирусной ДНК, ранее обнаруженных в геномах человека. Исследование охватило полные геномы людей со всего мира, включая большое количество образцов из Африки.
Находка в мире HERV
Открытие расширяет знания о человеческих эндогенных ретровирусах (HERV) — древних инфекционных вирусах, которые встроили копию своей РНК в геномы предков человека. Около 8% "человеческой" ДНК на самом деле имеет вирусное происхождение.
Новые HERV относятся к семейству HERV-K. Обнаруженный интактный провирус, названный Xq21, расположен на X-хромосоме. Это лишь второй интактный провирус, найденный в человеческой ДНК.
Ключевые цитаты:
- Джон Коффин, старший автор: "Этот [провирус] выглядит так, как будто способен создавать инфекционный вирус... Это исследование предоставляет важную информацию, необходимую для понимания того, как ретровирусы и люди эволюционировали вместе".
- Закари Уильямс, соавтор: "Многие интересные элементы встречаются только у небольшого процента людей, что означает необходимость скрининга большого числа людей, чтобы найти их".
- Джеффри Кидд, соавтор: "Это остатки древних событий, которые не закрепились в популяции в целом, а произошли у предков некоторых ныне живущих людей".
Генетическая командная работа
Исследователи из Университета Тафтса и Мичиганского университета использовали комплементарные методы анализа. Многие изученные геномы были предоставлены проектом "1000 геномов" и проектом "Геномное разнообразие человека".
Образцы из Африки показали больше признаков HERV, что согласуется с высоким уровнем генетического разнообразия африканских популяций.
Для полного каталогизирования всех вставок HERV в ДНК человека потребуется ещё больше сканирований полных геномов. Влияние последовательностей HERV на здоровье или болезни, вероятно, значимо.
