Защита деревьев-«живых ископаемых»
Учёные используют передовые технологии секвенирования ДНК для защиты деревьев-«живых ископаемых» на Фиджи от последствий изменения климата.
Доктор Питер Прентис из QUT заявил, что результаты позволят понять, как формируется биологическое разнообразие. Фиджи — это хотспот биоразнообразия, большинство видов там эндемичны.
Проект изучает происхождение островных видов в этих древних группах деревьев. Для этого будет использован ДНК-секвенатор Ion Torrent стоимостью $150 000. Он позволит определить гены у трёх пар видов деревьев:
- Cynometra falcata (находящийся на грани исчезновения) и C. insularis
- Degeneria vitiense (уязвимый) и D. roseiflora
- Podocarpus affinis (уязвимый) и P. neriifolius
Исследователи сравнят уязвимые или исчезающие виды с более распространёнными на Фиджи, чтобы найти гены, важные для становления уникальности, и понять эволюцию редких видов.
Эта работа поможет спрогнозировать, как деревья адаптируются к изменению климата. По словам доктора Прентиса, необходимо понять, как создаётся биоразнообразие, чтобы сохранить его в будущем, когда видам придётся реагировать на меняющиеся условия и учащение экстремальных событий, таких как циклоны. Пока неизвестно, обладают ли эти «живые ископаемые» потенциалом для адаптации.
Новая технология Ion Torrent ускорит исследования, позволив анализировать десятки тысяч генов одновременно, тогда как стандартный секвенатор работает лишь с несколькими генами. «То, что на Ion Torrent делается за пару часов, эквивалентно шести месяцам работы на стандартном секвенаторе», — отметил Прентис.
Этот прибор, способный секвенировать целые микробные геномы и специфические гены у людей, насекомых и растений, будет использоваться в исследованиях в области здоровья, сельского хозяйства и эволюции.
Исследование доктора Прентиса, проводимое совместно с доктором Гуннаром Кеппелом из Университета Кёртина, получило финансирование в размере $40 000 от Australian Pacific Sciences Foundation. Предварительная статья «Diversification history and hybridisation of Dacrydium (Podocarpaceae) in remote Oceania» была опубликована в Australia Journal of Botany.