Динамика денисовской примеси у евразийцев за последние 40 000 лет
Современные люди унаследовали часть своей ДНК от нескольких генетически различных групп денисовцев в результате скрещивания. Однако история контактов с денисовцами остаётся неясной.
В исследовании, опубликованном в журнале Current Biology, учёные впервые провели систематический палеогенетический анализ сегментов ДНК, унаследованных от денисовцев и выявленных у древних и современных людей. Проследив эти сегменты за последние 40 000 лет, они восстановили динамику денисовской примеси во времени и пространстве по всей континентальной Евразии.
Прослеживание денисовской примеси во времени и пространстве
Собрав опубликованные древние геномы со всей Евразии, команда обнаружила, что некоторые из самых ранних восточных азиатов, например, индивид Тяньюань из Китая (~40 000 лет назад), имели самый высокий уровень денисовской примеси (более 0,2%) среди всех изученных более поздних древних и современных людей. Однако паттерны общих сегментов денисовской ДНК между индивидами указывают, что эта примесь произошла от общих эпизодов контакта с денисовцами, которые разделяли все восточные азиаты во времени.
«Это указывает, что имел место генный поток от источника с меньшей или нулевой денисовской примесью, который разбавил денисовскую примесь у ранних восточных азиатов», — объясняет популяционный генетик Стефан Пейрень, соавтор исследования. «Денисовская ДНК представляет собой мощный маркер для реконструкции истории популяций».
Ещё одним примером информативности денисовских сегментов ДНК о древних миграциях стало открытие, что денисовская примесь проникла в Западную Евразию, хотя и на минимальном уровне, в основном с распространением людей из Восточной Евразии около 12 000 лет назад.
Не все восточные азиаты встречали денисовцев
Другое неожиданное открытие касается древнего народа дзёмон с Японского архипелага и островов Рюкю/Окинава, которые внесли вклад в генофонд современных японцев. У дзёмон был самый низкий уровень денисовской примеси среди восточных азиатов, хотя её происхождение было тем же, что и у материковых популяций.
Это означает, что предки дзёмон происходили от линии, которая не контактировала с денисовцами, а свою денисовскую примесь получила от более позднего генного потока с материковой Восточной Азии. Альтернативно, эта линия получила ограниченный генный поток от денисовцев до отделения от других восточных азиатов, но пропустила последующий (и основной) денисовский генный поток на континенте.
«Это предполагает, что некоторые группы выбрали разные маршруты во время ранних расселений в Восточной Азии, или денисовцы были настолько малочисленны, что контакты с ними были редки», — говорит ведущий автор Цзяци Ян, аспирант Института эволюционной антропологии Макса Планка.
Хотя знания о происхождении дзёмон и других восточных азиатов в палеолите всё ещё ограничены, эти находки подчёркивают сложную и регионально разнообразную историю взаимодействий между современными людьми и денисовцами. Дальнейшие данные древней геномики помогут прояснить время и характер этих взаимодействий.