Генетический ответ дельфинов на вирус
Исследователи из Университета Флиндерс секвенировали геномы дельфинов и выявили вариации, которые могут влиять на их смертельный иммунный ответ на вирус, родственный кори.
Изменение климата и модификация среды обитания угрожают изменить динамику заболеваний, приводя к появлению вирусов в некоторых популяциях. Эти вирусы могут вызывать массовую гибель, ограничивать генетическое разнообразие и приводить к сокращению популяций и локальным вымираниям.
«Вспышки заболеваний, связанные с вирусами, в популяциях диких животных становятся все более частыми, поэтому крайне важно понимать, как генетические факторы влияют на восприимчивость к болезням», — говорит доцент Лючиана Мёллер, старший автор исследования.
Для китов и дельфинов недавно появился морбилливирус китообразных, унесший тысячи жизней и ставший одной из величайших угроз для популяций во всем мире.
За семимесячный период в 2013 году в водах Южной Австралии, особенно в заливе Сент-Винсент, погибло не менее 50 дельфинов. Исследователи из Южноавстралийского музея подтвердили, что морбилливирус китообразных, вирус, родственный человеческой кори, был основным способствующим фактором гибели дельфинов.
Это была первая подтвержденная вспышка смертности, связанная с морбилливирусом китообразных, в Южной Австралии и крупнейшая в Австралии.
Чтобы понять иммунный ответ дельфинов на вирус, команда под руководством Университета Флиндерс секвенировала геномы выживших и погибших афалин из этой вспышки.
«Секвенируя весь геном афалин, мы можем углубить наши знания об этом виде многими способами. Один из них — понять, как дельфины реагируют на инфекцию и борются с вызывающим обеспокоенность вирусом», — говорит Мёллер.
Сравнение геномов выживших и погибших особей выявило различия в ДНК дельфинов в пятидесяти генах, связанных с иммунитетом, которые могут быть важны для борьбы с инфекцией.
«Что действительно интересно, так это то, что один из этих генов также, как предполагается, важен для иммунного ответа человека на вирус кори», — говорит аспирант Кимберли Бэтли, ведущий автор.
«Таким образом, эти результаты не только представляют собой шаг к пониманию того, как генетические факторы хозяина влияют на восприимчивость к болезням в дикой популяции, но и предоставляют дополнительные доказательства роли конкретных генов в борьбе с морбилливирусами у млекопитающих в целом».
«Используя эти знания, мы можем провести скрининг других популяций и видов по всему миру, чтобы определить те, которые могут подвергаться повышенному риску массовой гибели в случае вспышки морбилливируса», — говорит Бэтли.
Поскольку окружающая среда продолжает меняться и становиться более стрессовой, эти данные могут оказаться критически важными для сохранения популяций, подверженных риску гибели от вирусных вспышек.
Исследование «Полные геномы выявляют несколько генов-кандидатов и путей, участвующих в иммунном ответе дельфинов на высокоинфекционный вирус» (Whole genomes reveal multiple candidate genes and pathways involved in the immune response of dolphins to a highly infectious virus) Кимберли Бэтли, Джонатана Сандоваля-Кастильо, Кэтрин Кемпер, Никки Дзанардо, Икуко Томо, Лучано Бехерегарая и Лючианы Мёллер опубликовано в журнале Molecular Ecology.