Расшифрованы шесть новых геномов Candida и получены ключевые данные об эволюции патогенности

Международный консорциум под руководством исследователей из Университетского колледжа Дублина (UCD) с участием учёных из 21 института, включая центры секвенирования Wellcome Trust Sanger Institute (Великобритания) и Broad Institute (MIT и Гарвард, США), определил последовательности шести новых геномов грибов рода Candida и выявил генетические различия у видов, вызывающих заболевания.

Исследование, опубликованное в журнале Nature, описывает, как штаммы Candida эволюционировали и обеспечивали своё выживание, адаптируя свой генетический состав к изменениям окружающей среды. Виды Candida — наиболее частая причина оппортунистических грибковых инфекций в мире.

В частности, Candida parapsilosis представляет наибольшую угрозу для пациентов после трансплантации и недоношенных детей, так как образует биоплёнку на внутренней поверхности медицинских устройств (имплантатов, катетеров, питательных трубок). Грибок устойчив к лекарствам, и единственное эффективное лечение — удаление устройства. До этой работы об этом виде было известно очень мало.

Команда UCD под руководством профессора Джеральдин Батлер изучила ключевые компоненты спаривания и деления клеток у видов Candida, пролив новый свет на то, как грибы размножаются и выживают.

Профессор Батлер, научный координатор проекта, начала работу по определению последовательности генов C. parapsilosis в 2003 году при финансировании Science Foundation Ireland. Она отметила, что начали с секвенирования небольших частей генома, что привело к сотрудничеству с Sanger Institute для секвенирования всего генома и, наконец, к объединению этого генома с другими, секвенированными Broad Institute.

Сравнив генетические последовательности у патогенных и непатогенных грибов, команда обнаружила, что у вызывающих болезни видов Candida, как правило, гораздо больше копий генов, вовлечённых в адгезию и формирование клеточной стенки. Липкость белков клеточной стенки облегчает прикрепление грибов к клеткам человека. Дальнейшее изучение регуляции этих белков может в будущем привести к разработке методов лечения грибковых инфекций.

Ключевой вывод: C. parapsilosis, вероятно, является единственным видом в роде, неспособным к спариванию, что меняет прежние представления о размножении этих грибов.

Подробнее: ‘Evolution of pathogenicity and sexual reproduction in eight Candida genomes’, dx.doi.org/10.1038/nature08064