Взрывной рост числа известных форм жизни
Исследователи из Университета Квинсленда помогли увеличить число известных геномов почти на 10%.
Профессор Джин Тайсон сообщил, что учёные получили 7280 бактериальных и 623 археальных генома из образцов окружающей среды. Это почти на 10% больше, чем 80 000 геномов, хранящихся в репозиториях.
"Реальная ценность этих геномов в том, что многие из них эволюционно отличаются от ранее полученных. Они увеличивают эволюционное разнообразие, охватываемое геномными деревьями бактерий и архей, более чем на 30% и являются первыми представителями 17 бактериальных и трёх архейных типов."
Большая часть микробного разнообразия ещё не открыта, так как большинство микробов, видимых под микроскопом, невозможно культивировать в лаборатории.
"Менее одного процента можно культивировать из-за медленных темпов роста, требовательных условий и необходимости перекрёстного питания с другими видами."
Однако современные технологии секвенирования и вычислительные методы позволяют получать микробные геномы напрямую из образцов окружающей среды, минуя культивирование.
"Примерно 8000 восстановленных геномов приближают нас к полному геномному представлению микробного мира, но также показывают, что многое ещё предстоит открыть."
Соавтор исследования доктор Донован Паркс отметил, что впервые у науки есть инструменты для существенного продвижения в изучении филогенетического и метаболического разнообразия жизни.
"Мы ожидаем, что обработка образцов из других публичных репозиториев добавит к древу жизни десятки тысяч микробных геномов. Инструменты постоянно совершенствуются."
Создание всеобъемлющего геномного репозитория микробного разнообразия закладывает основу для понимания роли микроорганизмов в критических биогеохимических и промышленных процессах.
Исследование опубликовано в Nature Microbiology.
