Портативные тесты выявляют болезни растений менее чем за 30 минут
Исследователи из Университета штата Северная Каролина (NC State) разработали простые в использовании тесты, способные выдать результат за считанные минуты, иногда до появления видимых признаков болезни у растений.
В статье, опубликованной в журнале Phytopathology, сообщается об успешном создании тестов для выявления заражения рододендронов патогеном Phytophthora ramorum (водяная плесень, оомицет).
Угроза для лесов и питомников
- P. ramorum представляет серьёзную угрозу для лесных деревьев и питомниковых растений (рододендроны, камелии, калина).
- Самый известный вызываемый им недуг — «внезапная смерть дуба» — уничтожил миллионы деревьев в Калифорнии и Орегоне.
- Патоген также поразил миллионы посаженных лиственниц в Ирландии.
Новый инструмент для быстрой диагностики
Новые генетические тесты призваны дать управляющим лесами и питомниками информацию, необходимую для быстрого предотвращения распространения болезни.
- Текущая проблема: стандартные лабораторные ПЦР-тесты занимают дни или недели.
- Решение: тесты LyoBead LAMP дают результат за 20–30 минут.
Как работает тест
Тест использует технологию изотермической амплификации с петлевой обратной связью (LAMP) и лиофилизированные гранулы (LyoBeads).
- Гранулы содержат все необходимые реагенты в одной пробирке.
- После добавления образца ДНК и буфера пробирку нагревают до 65°C в течение 15 минут с помощью портативного блока, работающего от прикуривателя автомобиля или солнечной батареи.
- Положительный результат определяется по визуальному изменению цвета с фиолетового на синий или с помощью камеры смартфона.
Разработанные варианты тестов
Исследователи создали четыре варианта анализа:
- Обнаружение любого вида Phytophthora, поражающего целевые растения.
- и 3. Специфичное выявление P. ramorum или P. kernoviae (вид, опасный для Европы, но не обнаруженный в США).
- Выявление наиболее распространённой в США линии P. ramorum — NA-1.
Перспективы
Технология LyoBead LAMP масштабируема для других патогенов растений. Такие недорогие и простые тесты ускоряют диагностику, сокращают нагрузку на лаборатории и могут интегрироваться в системы эпидемиологического надзора для сдерживания болезней.
