Новый полевой тест обнаруживает банановый грибок быстрее, чем когда-либо

Новый полевой тест, разработанный Вагенингенским университетом и исследованиями (WUR) для обнаружения Tropical Race 4 (TR4) – штамма Fusarium, вызывающего опасную панамскую болезнь бананов, – дал положительный результат в Колумбии. Так называемый LAMP-тест (от Loop-Mediated Isothermal Amplification assay) помог быстро определить присутствие TR4 в этой южноамериканской стране. Тест WUR быстрее и практичнее лабораторных анализов и позволяет фермерам и властям немедленно принимать меры при положительном результате, чтобы предотвратить дальнейшее распространение грибка. LAMP-тест был разработан исследовательской группой под руководством профессора Герта Кемы (WUR).

Ранее диагностировать TR4 так быстро было невозможно, что является важным шагом для банановодов по всему миру. Панамская болезнь, вызываемая Fusarium, была катастрофической, часто уничтожая целые плантации, в то время как многие люди во всем мире зависят от этой культуры как источника пищи.

Удобный размер для полевых условий

Герт Кема, профессор фитопатологии в WUR, возглавляет группу, разработавшую новый тест. «Главное преимущество нового LAMP-теста в том, что он имеет удобный размер и может использоваться в полевых условиях. Больше нет необходимости привлекать лабораторию для анализа образцов. В принципе, любая компания, занимающаяся выращиванием бананов, может приобрести устройство, обучить сотрудников и немедленно его использовать».

Таким образом, новая техника очень доступна для компаний без лаборатории и для государственных учреждений. «Теперь им нужны лишь ограниченные средства, чтобы проверить, поражены ли какие-либо растения банана TR4, — объясняет Кема. — Результат они получают в течение часа. Быстрые тесты незаменимы для адекватного установления карантинных мер при любой пандемии. Это ключевое развитие для отрасли».

Комбинация тестов

Та же исследовательская группа WUR разработала первый молекулярный тест на TR4 в 2010 году. Коммерциализированный ClearDetections, этот тест теперь используется по всему миру и стал важным инструментом в обнаружении и карантине TR4. В последующие годы группа создала базу данных ДНК штаммов Fusarium, вызывающих панамскую болезнь. LAMP-тест использует новый уникальный фрагмент ДНК генома TR4, полученный из этой базы данных, поэтому два метода усиливают друг друга.

Размер с коробку из-под обуви

«Тренинги, которые мы организовали с властями Колумбии и производителями на Филиппинах, показали, что тест легко выполнить, — продолжает Кема. — Вы берете кусочек ткани, выделяете немного ДНК с помощью быстрого и простого процесса и помещаете её в устройство. Само устройство размером с коробку из-под обуви, поэтому его легко взять в поле. Этот тест особенно важен для картирования вспышки в районах, где грибок Fusarium только что появился».